Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
BudowaDNA
35
fobowym.Zasadytworząparywedługspecjalnychreguł:adenina(A)ztyminą(T)iguanina(G)zcytozyną(C).
ZawartośćparGCwnaturalniewystępującymDNAwahasięod22do73%,awartośćtamożewywieraćsilny
wpływnawłaściwościfizyczneDNA,np.natemperaturętopnienia.Temperaturatopnienia(T
m)DNAtotaka
temperatura,przyktórej50%podwójnejhelisyDNAjestrozplecionadopojedynczychnici.Rozdzielonenici
DNAmogądenaturować,czyliłączyćsięzesobą.Nicikomplementarne,pochodzącezróżnychcząsteczekDNA,
mogątworzyćpodwójnąhelisęwprocesiezwanymhybrydyzacją.
SekwencjepowtarzającesięwDNAprzyjmujączasaminietypowąstrukturędrugorzędową,takąjakstruktury
zawierającewybrzuszenia,strukturykrzyżowelubtrójniciowahelisa.Nietypowestrukturydrugorzędowemogą
wpływaćnareplikacjęitranskrypcję.NiektóreztychstrukturzależąodsuperhelikalnościDNA.Niemalcały
DNAkomórekpro-ieukariotycznychznajdujesięwstaniesuperhelikalnym,zwprowadzonymiujemnymisuper-
skrętami.Obecnośćujemnychsuperskrętówułatwiarozdziałniciwczasiereplikacjiitranskrypcji.FormyDNA,
któremajątęsamąsekwencjęnukleotydową,aleróżniąsięliczbąopleceń,nazywamytopoizomerami.Topoizome-
razysąenzymamirelaksującymisuperhelikalniezwiniętącząsteczkęDNAiprzekształcająjedentopoizomer
wdrugi,zmieniającliczbęopleceń.TopoizomerazyodgrywająważnąrolęwreplikacjiDNAiwtranskrypcjigenów.
Pytaniakontrolne
1DupleksyDNAprzedstawioneniżejzostałyzdenaturowane,anastępniepoddanepowolnejrenaturacji.Która
zdwóchcząsteczekbędziemiećwyższątemperaturętopnienia(T
m)?Któraznichnajprawdopodobniejnieprzyj-
miestrukturywyjściowej?Dlaczego?
(a)5!-ATATCATATGATATGTA-3!
3!-TATAGTATACTATACAT-5!
(b)5!-CGGTACTCGTGCAGGT-3!
3!-GCCATGAGCACGTCCA-5!
2Badaszbiałko,którepodejrzewasz,żemożemiećaktywnośćtopoizomerazy.Opisz,jakzaplanujesztestnaak-
tywnośćtegobiałkainvitro.Zaproponuj,jakiebędąwyniki.
3Kiedyustalonosekwencjęgenomukonikapolnego,okazałosię,że29%zasadtoadenina.
(a)Jakijestprocentzawartościcytozyny?
(b)JakijestudziałposzczególnychzasadwcałkowitymDNA?
(c)Jakajestzawartość[G]+[C]?
Literaturauzupełniająca
Bacolla,A.,Wells,R.D.(2004)Non-BDNAconformations,genomicrearrangements,andhumandisease.JournalofBiolo-
gicalChemistry279:47411-47414.
Blackburn,G.M.,Gait,M.J.(1990)NucleicAcidsinChemistryandBiology.IRLPress,Oxford.
Calladine,C.R.,Drew,H.R.,Luisi,B.F.,Travers,A.A.(2004)UnderstandingDNA.TheMoleculeandHowitWorks,3rdedn.
ElsevierAcademicPress,NewYork.
Chargaff,E.(1951)Structureandfunctionofnucleicacidsascellconstituents.FederationProceedings10:654-659.
Cortés,F.,Pastor,N.,Mateos,S.,Dominguez,I.(2003)RolesofDNAtopoisomerasesinchromosomesegregationandmi-
tosis.MutationResearch543:59-66.
Dickerson,R.E.(1983)TheDNAhelixandhowitisread.ScientificAmerican249:94-111.
Dickerson,R.E.,Bansal,M.,Calladine,C.R.etal.(1989)Definitionsandnomenclatureofnucleicacidstructureandpara-
meters.EMBOJournal8:1-4.
Ha,S.C.,Lowenhaupt,K.,Rich,A.,Kim,Y.G.,Kim,K.K.(2005)CrystalstructureofajunctionbetweenB-DNAandZ-
-DNArevealstwoextrudedbases.Nature437:1183-1186.
Herbert,A.G.,Spitzner,J.R.,Lowenhaupt,K.,Rich,A.(1993)Z-DNAbindingproteinfromchickenbloodnuclei.Proce-
edingsoftheNationalAcademyofSciencesUSA90:3339-3342.
