Treść książki

Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
16
II.Podstawygenetykiigenomiki
nowetechnologie,jakipowstanieodrębnejgałęzi
genetykimolekularnej,jakąjestgenomika.Geno-
mikaporównawczajużobecnieprzynosiodpo-
wiedźnaszeregpodstawowychpytańzzakresu
ewolucjigenomu,pochodzeniairoliposzczegól-
nychgenów.Celemgenomikifunkcjonalnejjest
badanienietylefunkcjidanegogenu,ileorganiza-
cjiikontrolidrógmetabolicznychodpowiada-
jącychzabiochemięifizjologiękomórki.Oznacza
torównocześniebadanieekspresjiwielugenówna
poziomietworzonychtranskryptów(analizatrans-
kryptomu).Kompleksowymibadaniamiekspresji
białekiichwzajemnychoddziaływańzajmujesię,
zkolei,proteomika.Niesposóbwtymkontekście
niewymienićbioinformatyki,atakżebadańinsilico,
któresamewsobiestanowiąwydzielonądziedzinę
umiejętności.
II.2.2.Strukturagenomu
Początkowetrudnościwsekwencjonowaniugeno-
muczłowiekaodzwierciedlaływpewnymstopniu
zróżnicowaniejegostruktury(tab.II-5).Szczegól-
niepoznaniedługichpowtarzającychsięsekwencji
nukleotydów,niezależnieodprzyjętejstrategiisek-
wencjonowania,odwlekłomomentopublikowania
pierwszegopełnegozapisuinformacjigenetycznej.
Sekwencjeunikatowe,wśródktórychznajdują
sięgenykodującebiałka,stanowiąjedynieokoło
1,5%całegogenomu.Sekwencjetetoswoistego
TabelaII-5.Strukturagenomuczlowieka
Częśćgenomu
(%)
Typsekwencji
Unikatowe(genykodującebialka)
~1,5
GenyRNA
~4
Powtórzone
~45
Inne
~50
rodzajuwyspywmorzusekwencjitylkoczęściowo
znanejfunkcji.Rzadkospotykasięzgrupowania
genów,takichjaknp.kodującerybosomowyRNA.
Genytewystępująbowiemwblokachwpięciu
różnychchromosomachczłowieka.
Sekwencjepowtórzone,toznaczywystępujące
wgenomiewwielukopiach,charakteryzująsię
określonąwielkością,rodzajemiukłademnukleo-
tydów.Stanowiąoneokoło40%genomu.Sekwen-
cjetezregułyniekodująbiałek.Wyróżniasię
wśródnichsekwencjerozproszoneisekwencje
tandemowe(ryc.II-6).
Sekwencjerozproszonedzielisięzkoleinasek-
wencjekrótkieidługie.Sekwencjekrótkie(ang.
shortinterspersednuclearelement,SINE)odłu-
gości130–300nukleotydówrozproszonewty-
siącachkopiiwcałymgenomie.Naprzykładsek-
wencjaAluodługościokoło300nukleotydówjest
„porozrzucana”pogenomiew1milioniekopii.
Sekwencjata,zaliczananiekiedydotranspozo-
nów,czylielementówzdolnychdoprzemieszcza-
niasiępogenomie,stanowiłącznieokoło10%
całegogenomu.Jejwystępowaniejestcharakte-
rystycznedlanaczelnychi,jaksięwydaje,możebyć
podatnanaredagowanieRNA.SekwencjęAlu
zlokalizowanorównieżwintronachgenówkodu-
jących0-ib-globinę,hormonwzrostuczyapolipo-
proteinęB.Wliczącym17kpzgenieinhibitoraC1
(mutacjetegogenuodpowiedzialnezadzie-
dzicznyobrzęknaczynioruchowy)zlokalizowano
17sekwencjiAlu.
Długiesekwencjerozproszone(ang.longinter-
spersednuclearelement,LINE)owielkościokoło
kilkutysięcynukleotydówreprezentują,podobnie
jaksekwencjaAlu,klasęsekwencjipochodzących
odtranspozonów.Szacujesię,żestanowiąone
około20%genomu.
Sekwencjetandemowe,nazywanerównieżsate-
litarnymi,tozblokowaneseryjnepowtórzenia
krótkiejsekwencjinukleotydów.Dzielisięjena
minisatelityimikrosatelity,któreróżniąsięmiędzy
sobąliczbąnukleotydówzawartychwpowtarza-
RycinaII-6.Rodzajesekwencjipowtórzonych