Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
najkrótsząprocedurę.WprzypadkubadaniaMALDI-TOFMSwykonywanego
np.bezpośredniozkrwitrzebausunąćbiałkainneniżdrobnoustrojowe.
Obiecująceprostetechnikimolekularneszybkowykryjąwmieszaninie
różnychkwasównukleinowychDNAposzukiwanychpatogenów,aleniedają
pewności,żepochodzionzżywychbakteriiodpowiedzialnychzawłaśnie
toczącąsięinfekcję.
Wwiększościtechnikpierwszyminajtrudniejszymetapemjestwskazanie,
którezobecnychwmaterialeklinicznymbakteriisąrzeczywistymczynnikiem
etiologicznym.Wiedza,jakąprzyniosłyostatnielata,pokazująca,jakliczne
iróżnorodnebakteriezasiedlająciałoczłowieka,każezjeszczewiększym
zastanowieniemotymdecydować.Diagnosta-mikrobiologwzględniełatwo
podejmiedecyzję,znajdującwmaterialeklinicznymbezwzględnepatogeny,
jednakwieleinfekcjimacharaktermieszany,anajwięcejbakteriiizolowanych
wlaboratoriach,uznawanychzaprzyczynęinfekcji,stanowiąpatogeny
oportunistyczne,którerówniedobrzemogąbyćwbadanejpróbceskładnikiem
mikrobiomuobecnegowstaniezdrowia.
Wrutynowychprocedurachlaboratoryjnychbadaniepróbkipochodzącej
odpacjentazaczynasięwięcnajczęściejposiewemnaodpowiedniepodłoża
stałe.Ważnajest,awprzypadkuniektórychmateriałówpodstawowa,
liczbakoloniipowstałychwwynikutegoposiewu,aleiróżnorodność
bakteriipozostającychwpróbcewmniejszości.Dobradecyzjadiagnosty
codorodzajupodłoża,apotemocenawynikuposiewudecydujeodalszym
postępowaniu.Tenetapjestnajtrudniejszydowykonaniaimusitrwaćkilka,
anajczęściejkilkanaściegodzin.Dalszyetap:wybórtechnikiidentyfikacji
bakteriizależyzwykleodprofiluiwyposażenialaboratorium.Nowoczesne
technikibiochemiczneispektrofotometrycznemająwieleograniczeń,jednak
wydajesię,żenajwiększymograniczeniemjestwielkośćikonstrukcjabaz
danych,naktórychpodstawieodczytywanesąwyniki.Automatycznetechniki
biochemiczneprawidłowoidentyfikująwprawdzieokoło80%bakterii,ale,jak
podkreślasięwbadaniach,pewnośćidentyfikacjidotyczytylkoichrodzaju.
WprzypadkuMALDI-TOFMS,mimożeniektórebazyobejmująnawetcztery
tysiącegatunków,nierzadkiesąsytuacje,gdywynikidentyfikacjirozdziela
prawdopodobieństwoprzyporządkowaniamiędzydwa,aczasemitrzygatunki.
Przyczynatkwizapewnewprzedstawionejwyżejzasadzieidentyfikacjigatunków
napodstawieSSSD.Wobecbogactwapangenomówwielugatunkówzasada
tamożeprowadzićdobłędów.Wprzypadkumetodmolekularnychtakczęsto
wskazywanychjakoszybkieibardzoczułeprzeszkodąjestwłaśnieowaczułość,
którapozwalawykryćwmaterialeklinicznymDNApatogenudługopotym,jak
jużworganizmieniemażywychkomórek.Podkreślasięteżniebezpieczeństwo
wykryciazanieczyszczeńpochodzącychzpobierania,transportuczyprocedur
badawczychioparciadiagnozynatakimwłaśniewyniku.
Szerokawiedzamikrobiologaprowadzącegobadaniediagnostyczne
wpostępowaniuklinicznymmaistotneznaczenie.Brakwskazaniapatogenu
iokreśleniaprofilujegowrażliwościnalekiprzeciwdrobnoustrojoweprowadzi
12
