Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
Mapapeptydowa(ang.peptidemap)
Widmomasoweprzedstawiającejonypochodzącezpróbkizawierającejmieszaninępeptydów,
uzyskanychwwynikuproteolitycznegotrawieniacząsteczkibiałka.Mapapeptydowaumoż-
liwiaidentyfikacjębiałekprzyużyciubazydanychtypuSwissProtlubNCBI,napodstawie
mascharakterystycznychfragmentówpeptydowych(ang.fingerprinting).
Masamonoizotopowa(ang.monoisotopicmass)
Masamolowaobliczonadlacząsteczkizbudowanejjedynieznajczęściejwystępujących
izotopówpierwiastków.Przykładowo,masamonoizotopowapeptyduKGGMliczonaze
wzorusumarycznegoC
15H
29O
5N
5Swynosim=3919189Da(dla
12C;1H;16O;14Noraz32S).
Masauśredniona(ang.averagemass)
Masamolowaobliczonadlapulicząsteczek,składającychsięzpierwiastkówiichizotopów
występującychwstanienaturalnym.MasauśrednionaliczonadlapeptyduKGGMbędzie
wynosićm=391,493Da.Masataróżnisięodmasymonoizotopowejdlategosamegopep-
tyduookoło0,304Da.Masauśrednionaróżnisiętymbardziejodmasymonoizotopowej,
imwiększajestcząsteczka.Kilkaprzykładówpodanowtabeli3.1.
Tabela3.1
Różnicemas:monoizotopowejiuśrednionej,obliczanychdlaróżnychcząsteczek
Tryptofan
Globinaalfaludzka
Chymotrypsynogenwołowy
Transferynaludzka
Huntingtynaludzka
Plektyna1ludzka
Cząsteczka
Masamonoizotopowa
3476389899
5314129026
256499765
751329553
151169885
1869079
Masauśredniona
3478629667
5317409959
256669354
751829172
15126948
1869213
2239768
Różnica
3289933
169589
499619
09134
99595
Pikchromatograficzny(ang.chromatographicpeak)
Wyróżnionyfragmentchromatogramucharakteryzującysięznaczniewiększąwartościąsygna-
łuzdetektora,zuwzględnieniemzmieniającychsięwłaściwościfizykochemicznycheluentu.
Pikizotopowy(ang.isotopicpeak)
Sygnałnawidmiemasowym,reprezentującystosunekmasydoładunkujonów,posiadających
tensamskładizotopowy.Przykładowo,cząsteczkaglukozy(C
6H
12O
6)będziereprezentowa-
nanawidmiemasowym(ESI,jonizacjadodatnia,pojedynczyładunek)przezconajmniej
trzyjony(m/z=181,07;182,07oraz183,07),przyczympierwszyzseriipikówbędzie
najbardziejintensywny.Składpierwszegopikuizotopowegoodzwierciedlawystępowanie
wcząsteczcenajczęściejspotykanychwnaturzeizotopówwęgla(
12C),tlenu(16O)iwodoru
(
1H).Jonom/z182,07możebyćzłożonyzizotopówoinnychmasach,np.(12C
5
13C
1)
1H
12
16O
6;
12C
6(
1H
11
2D
1)
16O
6.Wprzypadkutrzeciegopikuizotopowego9wmiejscedwóchdowolnie
29
