Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
Wstęp
XXI
sobą,zczasemjednakwyścigprzekształciłsięwewspółpracę,dziękiczemubadanianie
byłydublowane,copozwoliłonakontrolęwiernościodczytu.Wmaju2001r.zespoły
opublikowałyniezależniewynikiswoichbadań[201,379],awkwietniu2003r.ogłosiły
zakończenieprojektów.Badaniawykazały,żegenomludzkizłożonyz3mldparzasad
zawiera30000genówkodującychbiałkaorazmolekułyRNA,costanowiok.1,5%
całościDNA.Resztatotzw.pozagenowy(nśmieciowy”)DNAskumulowanypodczas
ewolucjiczłowieka[390].
DorozszyfrowaniatajemnicDNAwfirmieCeleraużytokomputerarównoległego
oarchitekturzeklastrowejskładającegosięzdziesięciu4-procesorowychwęzłówSMP,
każdyzpamięcią4GB(CompaqES40)oraz16-procesorowegokomputeratypuNU-
MA(ang.nonuniformmemoryaccess)wyposażonegowpamięćopojemności64GB
(CompaqGS160).WykonanieprogramusekwencjonowaniaDNAwymagałook.20000
godz.obliczeń[379].InfrastrukturaobliczeniowakonsorcjumHGPobejmowałaserwer
obliczeniowyzłożonyz27węzłówCompaqES40o108procesorachorazserwerplików
zpamięciązewnętrznąopojemności1TB[201].
Mimozgromadzeniadużejwiedzyoludzkimgenomienawielepytańniemajeszcze
odpowiedzi.Niewiadomo,jakąrolęodgrywająpseudogeny,któremającpostaćgenów,
niekodująbiałek.Cooznaczannieciągłość”genówzwiązanazobecnościątzw.intro-
nóworazczypozagenowyDNAzawierajednakużyteczneinformacje?Dalszebadania
genomubędąwięctrwały,ponieważjegopełnepoznaniejestważnedlawieludzie-
dzin.Naprzykładwmedycyniepozwolinadiagnozęchoróbdziedzicznychopodłożu
genetycznyminaprowadzenieterapiigenowej.Testygenetycznejużterazpozwalają
ustalićojcostwoorazsąstosowanewkryminalistyce.Wprzyszłościwiedzagenetyczna
umożliwiindywidualnedopasowywanielekówdopotrzebchorych,cowydłużyżycie
ludziipoprawijegokomfort.Ważnejesttakżepoznaniegenomówroślin.Drogąichmo-
dyfikacjimożnabowiemwyhodowaćnoweodmianyroślincharakteryzującesięwiększą
plennością,atakżeodpornościąnasuszeiszkodniki.Przykładowo,wynikibadańnad
rozszyfrowaniemgenomukukurydzyprzyużyciu1024-procesorowegokomputeraBlue
Gene/L[139,140]przedstawionowpracyKalyanaramanaiin.[210].
Wostatnichdekadachobserwujesięwzrostrolikomputerówwbadaniachnauko-
wych.Niektóreodkrycia,np.wspomnianewyżejodczytaniegenomuludzkiego,zostały
dokonanedziękiznacznymmocomobliczeniowym.Stosowaniezaawansowanychmetod
iśrodkówinformatykidorozwiązywaniazłożonychproblemówjestdomenątzw.nauki
obliczeniowej(ang.computationalscience).Trzecimfilaremtejnauki,obokteoriioraz
eksperymentu,jestkomputerowemodelowanieisymulacjazjawiskodużejskali.Ranga
naukiobliczeniowejwkontekściekonkurencyjnościorazdobrobytuspołeczeństwajest
przedmiotemraportuzespołudoradcówprezydentaUSA[306].
Superkomputerytoinstalacjedrogie,okosztachrzędudziesiątekmilionówdo-
larów.Dlategoprzezdługiczaspozostawaływyłącznienawyposażeniurządowych
instytucjibadawczych.Jednakostatniozaczęłysięonepojawiaćwsektorachprzemy-
słowychodużychdochodach.Przedsiębiorstwapaliwowekorzystajązszybkichkom-
puterówdoefektywnegozarządzaniaistniejącymizłożamiropynaftowejigazu[219]
(http://access.ncsa.uiuc.edu/Stories/oil)orazdoposzukiwanianowychzłóż.Producenci
