Treść książki

Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
1.Celeantybiotykówwkomórcebakteryjnejisposób,wjakiatakowane
21
łańcuchapolinukleotydowego.Takitypreplikacjinazywasięsemikonserwatyw-
nym,ałańcuch,doktóregodobudowywanyjestuzupełniający,nazywanyjestma-
trycą.ReplikacjaDNAubakteriirozpoczynasięwmiejscuspecyficznejsekwen-
cjidługościokoło250zasad,rozpoznawanejprzezbiałkainicjatorowe,przede
wszystkimDnaA.ZkoleidoDNAprzyłączasięhelikaza(DnaB),którejpomaga
wtymbiałkoDnac.Dwiehelikazyumiejscawiająsięnaprzeciwległychniciach
DNA,rozwijającdwuniciowąstrukturę,dziękiwykorzystaniuenergiizATP.
Zanimilokująsiędwiecząsteczkiprymazyidwiecząsteczkipolimerazy.
Jakwidać,wreplikacjiDNAwkomórkachbakterii,np.Escherichiacoli,udział
bierzekilkawspółpracującychbiałek.Wwidełkachreplikacyjnychwspółpracu-
jącebiałkatohelikaza(DnaB),prymaza(DnaG),gyraza,tetramerycznebiałko
wiążącejednoniciowyDNA(ang.ssb,single-strandedbindingprotein)orazho-
loenzympolimerazaDNAIII.Tenzespółbiałeknosinazwęreplisomu(ryc.1.2),
wktórymhelikazazprymazątworząpodkompleksprymosomu.
PolimerazaDNAIIIzkoleiskładasięztrzechpodkompleksów:(a)rdzenia
αεθ,któryobejmujepolimerazę5!-3!orazaktywnośćkorektorską3!-5!,(b)za-
ciskuślizgowegoβ
2(ang.slidingclamp),którychronipolimerazęprzedłatwym
odpadaniemodmatrycyoraz(c)elementu(τ/γ)
3
δδψχustawiającegozacisk
(ang.clamploader).Tenostatninietylkoprzenosizaciskβ
2okształciepierście-
nianaDNA,lecztakżenadzorujeuorganizowaniewidełekreplikacyjnych,wcho-
dzącwinterakcjezrdzeniem,helikaząiSSB.Rolategoostatniegobiałkapole
-
ganastabilizacjijednoniciowejformyDNA.Wrównoczesnejreplikacjidwóch
pierwotnychniciDNAbiorąudziałprzynajmniejdwardzenieztrzech,które
mogąwiązaćelementotwierającyzatrzask.BiałkoSSBnietylkochronijednoni-
ciowyDNA,aleiwchodziwinterakcjezbiałkamiuczestniczącymiwreplikacji
inaprawieDNAorazrekombinacji.Rozwijającaaktywnośćhelikazypowoduje
powstawaniesuperskrętówDNA,ituważnąrolęodgrywająenzymygyrazaito-
pizomerazaIV.Gyrazapoprzedzawidełkireplikacyjne,wprowadzającrównowa
-
żącenegatywnesuperskręty.Wykazano,żewdowolnymmomenciecyklukomór-
kowegozchromosomemzwiązanychjestconajmniej300resztgyrazy.Podobną
rolęwkontrolowaniustopniasuperskręceniabakteryjnegoDNAodgrywatopo-
izomerazaIV.Pobardziejszczegółowyopis,szczególnieetapuinicjacji,odsyłamy
Czytelnikadoliteraturyuzupełniającej.
PonieważgenomE.coli,jakiinnychorganizmów,zbudowanyjestzdwóchnici
oprzeciwległejorientacji,apolimerazaIIIsyntetyzujeDNAwyłączniewkierun-
ku5!-3!,jedynienićwiodącamożebyćsyntetyzowanawsposóbciągły,podczas
gdynićopóźnionapowstajewefragmentachdługości1000–2000nukleotydów,
zwanychfragmentamiOkazakiego.KażdyfragmentOkazakiegozaczynasięod
starteraRNAsyntetyzowanegoprzezprymazęDnaG,doktóregopolimerazaIII
dobudowujełańcuchDNA.DnaGsyntetyzujeprymerybardzoniewydajnie