Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
wwolnychaminokwasach(rys.2.1a,b).
Włańcuchupolipeptydowymobiegrupy
sąjednakzaangażowanewutworzenie
wiązaniaamidowegoiniedostępnedla
reakcjichemicznych(zwyjątkiemwiązań
wodorowych).Stądwłaściwościamino-
kwasówwbiałkudeterminujągłównieich
łańcuchyboczne(R).Ważnąrolęwaspek-
ciepolarnościspełniająponadto:amino-
kwaszwolnągrupąaminową(N-końcowy,
inaczej:N-terminalny,H
2
N-terminalnylub
aminoterminalny)postronielewejoraz
aminokwaszwolnągrupąkarboksylo-
wą(C-końcowy,inaczej:C-terminalny,
COOH-terminalnylubkarboksyloterminal-
ny)postronieprawejłańcuchapolipepty-
dowego(rys.2.1c).ZapisAla-Ser-Val
oznacza,żealaninaznajdujesięwN-koń-
cu,zaśwalinawC-końcutegopeptydu.
Podstawądozrozumieniazachowania
Rys.2.1.Właściwościmolekularneaminokwasów:
sięaminokwasówjakokomponentówbia-
aib)wolnychorazc)spolimeryzowanychwtri-
łekorazwolnych,metabolicznychinter-
(Zaadaptowano,zazgodą,z:
Lippincott’sIllustratedReviews:
mediatów[P57,s.56]stanowiątrzy
peptyd
Biochemistry
,ChampeP.C.,HarveyR.A.[P16],p.1,fig.1.1;
następującefakty:
©1987by
J.B.LippincottCompany
,Philadelphia,PA.Uzupeł-
1)WroztworzeopHobojętnymamino-
niono)
kwasywystępujązasadniczowformie
zjonizowanej,jakojonyobojnacze(jony
micznejstrukturze—równieżzwiązany
dwubiegunowe,dipolarne,ang.zwitte-
zwęglem0.
rions).Aminokwaswpostacijonuobojna-
Wzorynarys.2.1a,bprzedstawiają
czegomaprotonowanągrupęaminową
ogólnąstrukturęaminokwasuwformie
(łNH
+
3
)orazzjonizowanągrupękarbo-
niezjonizowanejizjonizowanej.Wobu
ksylową(łCOO–).Wroztworzekwaś-
zapisach,jakiwłańcuchupolipeptydo-
nym(np.pH1)cofasiędysocjacjagrupy
wym(rys.2.1c),grupa0-aminowaznaj-
karboksylowej—stajesięonaniezjonizo-
dujesiępostronielewej,grupa0-kar-
wana(łCOOH),anadalzjonizowana
boksylowazaśpostronieprawejwęgla
pozostaje
grupa
aminowa
(łNH
+
3
).
0każdegoaminokwasu,czyliatomuwęg-
Wroztworzezasadowym(np.pH11)cofa
laasymetrycznego(związanegozcztere-
siędysocjacjagrupyaminowej,którastaje
maróżnymipodstawnikami).Wyjątek
sięniezjonizowana(łNH
2
);nadalzjonizo-
stanowiprolina—iminokwas,któryza-
wanajestgrupakarboksylowa(łCOO–).
wieragrupęiminowązamiast0-amino-
2)Wszystkieaminokwasy(20)wy-
wej,itowbudowanąwpierścieńpięcio-
stępującepowszechniewbiałkach(poza
członowy,takżełańcuchbocznyjest
glicyną,wktórejR”H)mająasymet-
związanyzarównozatomemazotu,jak
rycznywęgiel0ztetraedrycznymułoże-
izwęglem0(por.rys.2.3).Wwarunkach
niemwokółniegoczterechróżnychpod-
fizjologicznych,tj.wśrodowiskuopH7,
stawnikówijakotakiesązwiązkami
zarównogrupa0-aminowajaki0-kar-
optycznieczynnymi(rys.2.2).Antypody
boksylowasązjonizowane,awięcpolarne
optyczne,mającesiędosiebiejakprzed-
22
