Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
20
AgnieszkaBachmura,AleksandraSztybor
znajdowałbysięnacharakterystycznymdlacząsteczekmRNApołączeniueg-
zon-ezgon.WprzypadkutranskryptuonumerzereferencyjnymNM_214390.1
udałosięodnaleźćparęużytecznychstarterówwyłącznienadługimostatnim
egzonie.Zestawieniesekwencji,właściwościfizykochemicznychorazparame-
trówumiejscowienianasekwencjireferencyjnejparstarterówzaprojektowanych
przyużyciuopracowanejproceduryzparamireferencyjnymiprzedstawiono
wtabeli1.
Tabela1.Porównaniewłaściwościstarterówreferencyjnychzzaprojektowanymi
przywykorzystaniuopisanejwniniejszejpracyprocedury.Genonumerze
akcesyjnymNM_214390.1jestnaniciantysensownej,więcstarteryzaprezentowane
wtabelisą„reversecomplement”.
Źródło:Opracowaniewłasne
Dyskusjaipodsumowanie
WmetodzieqPCRniezbędnajestumiejętnośćodpowiedniegozaprojekto-
waniastarterówookreślonychwłaściwościach.MetodailościowegoPCRjest
wrażliwanawieleczynnikówmogącychwpływaćnaprzebiegreakcji,przez
coetapwyszukiwaniaitworzeniaspecyficznychsekwencjistarterowychjest
niezbędnydoprawidłowegoprzebieguzaplanowanejreakcji.
Efektempowyższychbadańbyłozaproponowaniestosunkowonieskompliko-
wanejiprostejdozaimplementowaniaprocedurydooptymalizacjiprojektowa-
niastarterów,anastępniewykorzystaniaichwpóźniejszejpracylaboratoryjnej.
Woparciuosekwencjesprawdzonychlaboratoryjnestarterówreferencyjnych
transkryptówznajdującychsięwbaziedanychNucleotideNCBIpodjętopróbę
znalezieniasekwencjioptymalnychstarterówinastępnieporównaniaichdo
starterówreferencyjnych.Kolejnerygorystyczneetapyprocedurymająnacelu
