Treść książki

Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
substratu(np.glukooksydaza,enzym,któryutleniaglukozę)lubteżtypureakcji(np.polimerazalubizomerazaodpowiedzialnezareakcje
polimeryzacjilubizomeryzacji).Występująpewnewyjątkiodtejreguły,np.nazwypepsyna,renninaczytrypsyna.MiędzynarodowaUnia
Biochemii(IUB,ang.
TheInternationalUnionofBiochemistry
)opracowałapewnestandardynazewnictwaenzymów,którezakładają,
żenazwyenzymówpowinnywskazywaćzarównonaprzekształcanysubstratjakitypkatalizowanejreakcji.Szczegółoweinformacje
natematnazewnictwaenzymów,proponowaneprzezIUBmożnaznaleźćnastronieinternetowejIUB[3].
Klasyfikacjaenzymówjestopartanarodzajachkatalizowanychreakcjichemicznych.Oficjalniewyróżniasięsześćklasenzymów:
1.3.Enzymologia
Wszystkieżywekomórkiworganizmieczłowieka,zwierzęcia,mikroorganizmu,roślinyitd.miejscemwystępowaniaaktywności
biochemicznej,zwanejmetabolizmem.Metabolizmjesttociągłyprocesprzemianchemicznychifizycznych,którytrwanieprzerwanie
wżywymorganizmie;poleganapowstawaniunowychtkanek,zastępowaniustarychtkanek,konwersjipokarmuwenergię,wydalaniu
resztek,reprodukcjiczylitychwszystkichaktywnościach,któreokreślasięmianem„życia”danegoorganizmu.Jednakżerzadkoktóra
ztychreakcjibiochemicznychzachodzispontanicznie.Katalizaenzymatycznajestpotrzebna,abytereakcjebiochemicznemogłyzajść.
Ztegowzględuenzymyodpowiedzialnezazachodzeniewszelkichreakcjichemicznychwżywymorganizmie.Bezudziałuenzymów
tereakcjechemicznezachodziłybyzbytwolno,coutrudniałobymetabolizm.
1.3.1.Funkcjeenzymówwnaturze
Enzymypełniąszeregrozmaitychfunkcjiwżywymorganizmie.oneniezbędne
dotransdukcjisygnałóworazregulacjicyklukomórkowego,częstozudziałemkinazorazfosfataz[4].Ponadtoodpowiadająone
zagenerowanieruchu,czegoprzykładstanowimiozynahydrolizującatrifosforanadenozyny(ATP),bygenerowaćskurczemięśnijak
równieżprzepływskładnikówwobrębiekomórki,jakoelementcytoszkieletu[5].Zatemmożnapowiedzieć,żeszlakimetaboliczne
wkomórceuzależnioneodrodzajówiilościenzymówobecnychwtejkomórce.
Enzymypełniąrównieżistotnąfunkcjęwukładziepokarmowymssakówiinnychzwierząt.Enzymytakiejakamylazyrozkładająduże
cząsteczkiskrobi;proteazyzaśodpowiedzialnezarozkładdużychcząsteczekbiałek.Skutkiemtychreakcjijestpowstawaniemniejszych
fragmentów,którewłatwysposóbmogąbyćabsorbowanewjelitachzwierząt.Cząsteczkiskrobizbytduże,abymożliwabyłaich
absorpcja,leczdziękidziałaniuenzymówdochodzidohydrolizyłańcuchówskrobidopostacimniejszychcząsteczek,takichjakdekstryny,
maltozaorazostatecznieglukoza,któramożebyćwchłaniana.Różneenzymytrawiąróżnesubstancjepokarmowe.Uprzeżuwaczy,które
roślinożerne,mikroorganizmybytującewjelitachwytwarzająenzymytakiejakcelulaza,któreodpowiedzialnezarozkładcelulozy
obecnejwścianachkomórkowychwewłóknachroślinnych[6].
Kilkaenzymówmożedziałaćrazemwściśleokreślonejkolejności,tworząctymsamymszlakimetaboliczne.Wdanymszlaku
metabolicznymjedenenzymprzyjmujedanyproduktpochodzącyodinnegoenzymujakosubstrat.Pozakończeniureakcjikatalitycznejjej
produkttrafiadokolejnegoenzymu.Niekiedywięcejniżjedenenzymmożekatalizowaćsamąreakcjęrównocześnie;umożliwia
tobardziejzłożonąregulację:naprzykładprzyniskiejstałejaktywnościjednegoenzymu,leczindukowanejwysokiejaktywnościdrugiego
enzymu.Enzymydecydująotym,jakiekolejnereakcjezachodząwszlakachmetabolicznych.Bezudziałuenzymówmetabolizmmógłby
alboniezachodzićwpowtarzalnysposób,alboniebyłbydostatecznieszybki,abysprostaćpotrzebomdanejkomórki.Szlakmetaboliczny,
takijakglikoliza,niemógłbyistniećbezudziałuenzymów.Przykładowo,glukozamożebezpośrednioreagowaćzATP,przezcodochodzi
dofosforylacjijednejlubkilkugruphydroksylowych,związanychzatomamiwęgla.Bezudziałuenzymówmogąpowstaćróżneprodukty
fosforylacji.Jednakżewobecnościenzymu,takiegojakheksokinaza,fosforylacjaprzywęglu-6wcząsteczceglukozyzachodziwyjątkowo
szybko,przyczyniającsiędowytworzeniaznaczniewiększejilościglukozo-6-fosforanuwporównaniuzilościąproduktówpowstałych
nadrodzepowolnych,niekatalizowanychreakcji.Wkonsekwencjisiećszlakówmetabolicznychwobrębiekażdejkomórkizależy
odzestawufunkcjonującychwnichenzymów.
1.3.2.Chemiaenzymów
Enzymysąbiałkamiglobularnymi,zawierającymiodniecoponad60doponad2500resztaminokwasowych,coodpowiadamasie
cząsteczkowejMWwprzedziale6000–250000.Aktywnośćenzymówjestuzależnionaodichtrójwymiarowejstruktury[7].Większość
enzymówjestznaczniewiększaodsubstratów,naktóreoddziałuje.Dlategoteżfakt,żejedynieniewielkaczęśćcząsteczkienzymubierze
udziałwkatalizie,jesttymbardziejniezwykły[7].Taniewielkaczęśćnosinazwęmiejscaaktywnegoizazwyczajzawierazaledwiekilka
resztaminokwasowych(34),którebezpośredniouczestnicząwprocesiekatalitycznym.Substratzazwyczajulegazwiązaniuwbliskim
sąsiedztwielubbezpośredniowmiejscuaktywnym.
1.3.3.Specyficznośćenzymów
Jednązkluczowych,atymsamymniezwykleintrygującychwłaściwościenzymów,jestichspecyficzność.Niektóreenzymycechuje
specyficznośćabsolutna.Oznaczato,żeenzymytekatalizująwyłączniejedenokreślonyrodzajreakcji.Zkoleiinneenzymywykazują
specyficznośćwodniesieniudookreślonegorodzajuwiązaniachemicznegolubteżgrupyfunkcyjnej.Zasadniczowyróżniasięczteryróżne
typyspecyficzności: