Treść książki

Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
zazwyczajwykazywanaprzynieograniczonymstężeniusubstratu.
1.5.2.Stężeniesubstratu
Jakwykazanodoświadczalnie,jeśliilośćenzymujestutrzymywananastałympoziomie,astężeniesubstratuwzrastastopniowo,
toszybkośćreakcjirównieżrośnie,domomentuosiągnięciawartościmaksymalnej.Odtegomomentuewentualnywzroststężenia
substratunieprzyczyniasiędowzrostuszybkości.Przyjmujesię,żejeśliosiągniesięmaksymalnąszybkośćreakcji,towszystkiecząsteczki
enzymuprzekształconewkompleksES.WartościstałejMichaelisawyznaczonodlawielustosowanychpowszechnieenzymów.Wielkość
stałej
K
Minformujenasowieluistotnychkwestiachdotyczącychdanegoenzymu:
1.5.3.Allosteria
Allosterialuballosterycznaregulacjaenzymujestregulacjąaktywnościenzymulubinnegobiałka,polegającąnawiązaniucząsteczki
efektorawmiejscuallosterycznymbiałka.Miejsceallosteryczneznajdujesięwinnymmiejscuniżmiejsceaktywneenzymu.Efektory,
którezwiększająaktywnośćenzymu,określasięmianemaktywatorówallosterycznych,tezaś,którezmniejszająaktywnośćbiałka,noszą
mianoinhibitorówallosterycznych.Biorącpoduwagęsammechanizm,toinhibicjaallosterycznajestformąinhibicjiniekompetycyjnej(por.
p.1.5.6.3).
Terminallosteriapochodzizgreki,wktórej
allos
oznacza„inny”,zaś
steros
to„przestrzeń”,coodzwierciedlafakt,żemiejsceregulatorowe
jestinneodmiejscaaktywnegoenzymu.Regulacjaallosterycznajestnaturalnymprzykłademkontrolinadrodzesprzężeniazwrotnego.
1.5.4.Kofaktory
Wieleenzymówwymagaobecnościinnychskładników,tzw.kofaktorów,któreniezbędnedoichaktywnościkatalitycznej.Tenaktywny
kompleksokreślasięmianemholoenzymu;jesttopołączenieapoenzymu(białkowejczęśćenzymu)zkofaktorem(koenzymem,grupą
prostetycznączyteżaktywatoremwpostacijonówmetali),którenosiogólnąnazwęholoenzym.
Kofaktoremmożebyć:
Zazwyczajkofaktorytezwiązanebezpośredniowmiejscuaktywnymenzymulubbliskoniego.Ponadtoniektóreenzymywstanie
dodatkowoprzyłączaćinnecząsteczkiniżsubstratyczykofaktory,takiejakcząsteczkiinhibująceenzymczyzakłócająceproces
katalityczny.Wtensposóbreakcjaenzymatycznamożebyćregulowananapoziomiekomórki.Niektóreenzymyniepotrzebujążadnych
dodatkowychskładników,abymócosiągnąćpełnąaktywność.Jednakżeinnewymagająniebiałkowychcząsteczekzwanychkofaktorami,
abymócuzyskaćwłaściwypoziomaktywności.Kofaktorymogąbyćzwiązkaminieorganicznymi(np.jonamimetalilubklasteramiżelaza
isiarki)jakiorganicznymi(np.flawinaczyhem).Kofaktoryorganicznemogąwystępowaćwpostacigrupprostetycznych,któretrwale
połączonezenzymem,lubkoenzymów,któreuwalnianezmiejscaaktywnegoenzymuwczasietrwaniareakcji.Dokoenzymówzalicza
sięNADH,NADPHorazATP.Cząsteczkiteodpowiedzialnezaprzenoszeniegrupchemicznychpomiędzyenzymami.
Silniepołączonekofaktorywystępujązazwyczajwmiejscuaktywnymenzymuibiorąudziałwkatalizie.Naprzykładflawinaihembiorą
częstoudziałwreakcjachutleniania–redukcji.
1.5.5.Koenzymy
Koenzymytomałecząsteczkiorganiczne,przenoszącegrupychemicznezcząsteczkijednegoenzymudodrugiego[18].Niektóreztych
substancji,jaknaprzykładryboflawina,tiaminaorazkwasfoliowy,witaminami.Związkiteniepowstająsamoistnieworganizmie
idlategoteżnależyjemudostarczyćwzbilansowanejdiecie.Doprzenoszonychgrupchemicznychzaliczasięjonwodorkowy
(H)przenoszonyprzezNADlubNADP+,grupęacetylowąprzenoszonąprzezkoenzymA,grupęformylową,metenylowąlubmetylową
przenoszoneprzezkwasfoliowyorazgrupęmetylowąprzenoszonąprzez
S
-adenozylometioninę.
Zewzględunato,żekoenzymymodyfikowanechemiczniewskutekdziałaniaenzymu,wartojestpostrzegaćkoenzymyjakospecjalną
klasęsubstratów,lubdrugichsubstratów,którewspólnedlawieluróżnychenzymów.Przykładowo,około700znanychenzymów
wykorzystujekoenzymNADH[19].
Koenzymyzazwyczajregenerowalne,aichstężeniautrzymywanenastałympoziomiewewnątrzkomórki.
1.5.6.Inhibitory
Inhibitoryenzymówtosubstancje,którewpływająnadziałaniekatalityczneenzymuiprowadządostopniowegospowolnieniakatalizy,
aniekiedynawetdocałkowitegojejzatrzymania.
WiększośćistniejącychteoriidotyczącychmechanizmówinhibicjiopierasięnaistnieniukompleksuES.Doinhibicjiprzezsubstratmoże
dojśćwprzypadkunadmiernejilościsubstratuwśrodowiskudanejreakcji.
Występujątrzypodstawowetypyinhibicjienzymówkompetycyjna,niekompetycyjnaorazinhibicjaprzezsubstrat.Ponadtowyróżniasię
równieżinhibicjęmieszaną.
1.5.6.1.Inhibicjakompetycyjna
Inhibicjakompetycyjnawystępujewówczas,gdyzarównosubstratjakisubstancjaprzypominającatensubstratzostanądodane
doenzymu.Modelzamkaiklucza,dotyczącykatalizatorówenzymatycznych,jestwykorzystywanydowyjaśniania,dlaczegodochodzi
doinhibicji.
Zgodnieztymmodelemokreślonaczęśćpowierzchnienzymuwykazujesilnepowinowactwodosubstratu.Substratjestprzyłączanywtaki
sposób,żebyułatwićjegokonwersjęwproduktreakcji.Jednakżeinhibitorprzypominającysubstratmożewspółzawodniczyćzsubstratem
opozycjęwmiejscuaktywnym.Jeśliinhibitorjestzwiązanywmiejscuaktywnymenzymu,toniejestonprzekształcanyprzezenzym.
Wtedymiejsceaktywnepozostajezablokowane.Wkonsekwencjiobserwowanareakcjajestspowalniania,ponieważczęśćdostępnych
miejscaktywnychenzymujestzajętaprzezinhibitor.Jeśliobecnajestniepodobnadosubstratusubstancja,któraniepasujedomiejsca