Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
ZmiennośćgenetycznaRNAwirusówwaspekcieichdiagnostyki
35
Tabela1.RóżnicewobjawachwywoływanychprzezróżnegenotypyPepMV
jawywystępującesporadycznie,Ln–lokalnenekrotyczneplamki
Nicotianatabacum„Xanthi”
N.tabacum„WhiteBurley”
N.benthamiana
N.affinis
N.debneyi
Daturainoxia
Physalisfloridana
L–objawylokalne,S–objawysystemiczne,s–infekcjabezobjawowa,„–”–brakobjawów,()–ob-
Roślinytestowe
PepMV-SW
(L),S
(L),S
(L),S
(L),S
L,S
L,S
L,S
GenotypEU
PepMV-No
(L),S
s,(S)
L,S
L,S
–
–
s
PepMV-PK
(L),S
(L),S
L,S
–
s
s
s
GenotypCh2
PepMV-Pa
Ln,S
L,S
–
–
–
s
s
Rys.2.RozdziałelektroforetycznyproduktówRT-PCR.StarteryPepUSTGB-D1
iPepUSTGR-R[19]nieamplifikowałyizolatówzgrupyeuropejskiej(PepMV-SW);
K–kontrolanegatywna,1–PepMV-PK,2–PepMV-SW,M–markerHyperLadderIII
(Bioline)
niekiedyrównieżwmasowejdiagnostyce,jakRT-PCR(ReverseTrans-
criptionPolymeraseChainReaction)orazRealTimeRT-PCR(reakcja
RT-PCRzanaliząprzyrostuilościproduktuwczasierzeczywistym).Nie-
stetyzewzględunadużezróżnicowaniegenetyczneniewszystkiepary
starterówamplifikująceizolatyzgrupyCh2sąskutecznewwykrywaniu
izolatówzgrupyEU(Rys.2).Zastosowanienieprawidłowejparystarte-
rówmożeprowadzićdofałszywychwyników.Techniką,którapozwoliła
nawykryciewszystkichtypówPepMVjestRealTimeRT-PCR,bowiem
zaprojektowaneprzeznasstarterywsposóbspecyficznyiczuływykrywa-
jąwirusawystępującegowroślinielubwnasionachnawetwbardzoni-
skiejkoncentracji.
ObserwowanazmiennośćgenetycznawobrębieizolatówTBRViBRSV
równieżmawpływnadiagnostykętychgatunków.Zastosowanienajpo-
