Treść książki

Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
24
Antybiotykiwdobienarastającejlekooporności
Byzachowaćintegralnośćkwasunukleinowegopodczastegoprocesu,gyraza
czytopoizomerazaIVtworząwiązaniakowalencyjnemiędzyresztamityrozyny
wcentrumaktywnymenzymuikońcami5!wmiejscuprzecięciaDNA,zpowsta-
niemprzejściowychkompleksów.
Gyrazaskładasięzdwóchidentycznychłańcuchówbiałkowychomasie105Da
(GyrA
2
)idwóchomasie95Da(GyrB
2
),kodowanychodpowiednioprzez
genygyrAigyrB.CięciawDNAkatalizowaneprzezpodjednostkęGyrA
(ryc.1.4).ReakcjatawymagahydrolizyATP
,którąprzeprowadzapodjednost-
kaB.Jakwspomniano,topoizomerazywprowadzajądwuniciowecięciadobak-
teryjnegogenomu.Taaktywność,niezbędnadoprawidłowegofunkcjonowania
komórki,potencjalniejednakmożeprowadzićdofragmentacjigenomu.Chino-
lonywistocieczyniąto,zabijająckomórkiprzezzwiększenieliczbykomplek-
sówtopoizomeraza-DNAwmiejscachprzeciętegoDNA.Antybiotykitezatem
segmentuT
uwolnienie
wolnagyraza
segmentuG
zlepienie
podjednostki
GyrA
wiązanie
doDNA
procesywna
kataliza
segmentuG
podjednostki
przecięcie
GyrB
segmentuT
transfer
przechwycenie
segmentuT
Ryc.1.4.Schematilustrującyaktywnośćgyrazy.Cyklkatalitycznygyrazy.Związaniedwóch
resztATPprzezgyrazępowodujedimeryzacjędomenATPazowychpodjednostekGyrBiprze-
chwycenieprzenoszonegosegmentuT(ang.transported)DNAwjamiemiędzypodjednost-
kamiGyrB.NastępnieenzymwprowadzadwuniciowecięciewsegmencieG(furtka,ang.gate)
DNA,przezktóresegmentTzostajeprzeniesiony.PoprzeniesieniusegmentuTgyrazazamyka
cięciawsegmencieG,asegmentTzostajeuwolnionyzkompleksu.Tymprocesomtowarzyszy
hydrolizadwóchresztATPorazwprowadzeniedwóchujemnychsuperskrętówdomatrycyDNA
(zazgodą:StracyM.,WollmanA.J.M.etal.2019.Single-moleculeimagingofDNAgyraseactivity
inlivingEscherichiacoli.NucleicAcidsRes.10;47(1):210-220;doi:10.1093/nar/gky1143)