Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
1.4.Systematykaprokariotów
Niektórenowoodkrytegatunkimająstatuskandy-
dacki(ang.statuscandidatus),nieudałosiębowiem
spełnićwszystkichwymogówformalnych(s.12),
abymożnabyłonowemugatunkowinadaćoficjalną
nazwę.Nazwętakiegogatunkupiszesięwcudzysło-
wiewnastępującysposób:nCandidatusMethylomira-
bilisoxyfera”(słowoCandidatuspisanewielkąliterą
idrukiempochyłym,zaśnazwarodzajowaigatun-
kowa-drukiemprostym).Przywielokrotnymcyto-
waniuwtekściemożnanazwęskracaćnastępująco:
nCan.M.oxyfera”.
Tylkoniektóreznaneoddawnabakteriemająpol-
skienazwy,np.Mycobacteriumtuberculosis-prątek
gruźlicy,Staphylococcusaureus-gronkowieczłocisty,
Escherichiacoli-pałeczkaokrężnicyitd.
11
1i4i2isystemklasyfkacjiprokariotów
Organizmysąklasyfikowaneigrupowanezgodnie
zichnaturalnympokrewieństwem,coumożliwiana-
dawanieimpoprawnychilogicznychnazwimoże
byćużytecznewidentyfikacjinowowyizolowanych
gatunków.Podejściefilogenetyczneprzyklasyfikacji
prokariotówstałosięmożliwezchwiląwprowadzenia
molekularnychmetodbadaniakwasównukleinowych,
wtymgenów16SrRNA.
Systemklasyfikacjiorganizmówjesthierarchiczny.
Istniejesiedemrangpodstawowych(obowiązkowych)
wklasyfikacjiorganizmów.Najniższyrangąjestgatu-
nek(łac.iang.species,s.12).Bliskospokrewnione
gatunkigrupujesięwrodzaje(łac.iang.genus).
Jedenlubwiększaliczbaspokrewnionychrodzajów
tworzyrodzinę(łac.familia),rodzinyłączysięwrzędy
tabela1i3iHierarchiataksonomicznaprokariotów
Nazwarangi
polska
łacińska
(charakterystyczna
końcówka)
-
phylum
classis
ordo
(-ales)
subordo
(-ineae)
familia
(-aceae)
genus
species
subspecies
angielska
Domena
Typ
Klasa
Rząd
domain
phylum
class
order
Podrząd
suborder
Rodzina
family
Rodzaj
Gatunek
Podgatunek
genus
species
subspecies
(łac.ordo),rzędywklasy(łac.classis),atezaśwtypy
(łac.iang.phylum).Dlabiologówzajmującychsięorga-
nizmamieukariotycznyminajwyższąrangąsąkróle-
stwa(łac.regnum),natomiastwielumikrobiologówza
najwyższąrangę,zaproponowanąprzezCarlaWoesego
w1990roku,uważadomeny,któreniesąformalnie
uznane.Opróczrangobowiązkowychistniejąteż
rangidodatkowe,np.podrzędyipodgatunki(tab.1.3).
Rangitakiejakrodzina,podrządirządmożnałatwo
rozpoznaćnapodstawiecharakterystycznychdlanich
końcówek:-aceaedlarodziny(np.Enterobacteriaceae
torodzinapałeczekjelitowych),-ineaedlapodrzędu
(np.Corynebacterineae)i-alesdlarzędu(np.Entero-
bacteriaceaewchodząwskładrzęduEnterobacteriales).
Niemaoficjalnieuznanejklasyfikacjiprokariotów,
regułybowiemMiędzynarodowegoKoduNomen-
klaturyProkariotów(InternationalCodeofNomen-
clatureofProkaryotes)niepokrywająrangpowyżej
klasy,niemateżdlanichoficjalnieuznanegonazew-
nictwa.Ztegopowoduichnazwywbaziehttp://www.
bacterio.net(Listofprokaryoticnameswithstanding
innomenclature,LPSN)sąpisanedrukiemprostym
iwcudzysłowie,np.nProteobacteria”,jakotypypro-
ponowane.Trzebatudodać,żewpublikacjachnauko-
wychipodręcznikach(takżewtym)niewieleosóbsię
dotegostosujeiautorzypisząProteobacteria.
BazaLPSNzostałastworzonaprzezprofesora
JeanaEuzéby’egow1997r.,apojegoprzejściuna
emeryturęw2013r.jestprowadzonaistaleaktualizo-
wanaprzezAidanaC.Parte.Możnawniejznaleźć
alfabetycznąlistęwszystkichnazwtaksonomicznych
bakteriiiarcheonówoficjalnieuznanych,tzn.opubliko-
wanychprzezInternationalJournalofSystematicand
Przykład1
Przykład2
Bacteria
Firmicutes
Bacilli
Lactobacillales
Archaea
Euryarchaeota
Methanomicrobia
Methanomicrobiales
–
–
Streptococcaceae
Methanospirillaceae
Lactococcus
Lactococcuslactis
Lactococcuslactissubsp.
cremoris
Methanospirillum
Methanospirillumhungatei
-
