Treść książki

Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
GenetycznaniestabilnośćkrótkichsekwencjipowtórzonychDNA
13
Tabela1B.ZmianaliczbypowtórzeńwybranychsekwencjiSSRwokreślonychgenach
H.influenzaeiN.meningitidis
Haemophilus
Neisseria
influenzae
meningitidis
Gatunek
bakterii
TA
CAAT
GACA
AGTC
G
TAAA
CTCTT
RodzajSSR
(5,3,)
hifA/9–13
lic1/3–32,lic2/2–36,
lic3/2–36
lgtC/7–36
mod/~40
lgtG/8–13
nadA/5–13
opa/zmienna
Gen/zmianaliczby
powtórzeńSSR
syntezafimbrii
syntezaLPS
syntezaLPS
metylotransferazasystemu
restrykcja–modyfikacja
syntezaLPS
adhezyna
białkopowierzchniowe
Kodowanafunkcja
Literatura
[1,15,69]
[19,68]
[70,71]
[16,72]
[15]
[22]
[73]
tydowaw6powtórzeniach,brakujenatomiastpowtórzeńsekwencjitrój-,
cztero-ipięcionukleotydowych[8,9].Znanesąjednakprzykładyinnych
szczepówtegogatunku,wgenomachktórychzlokalizowano,coprawda
nieliczne,mono-idwunukleotydoweSSR(odpowiednioGniGCn)oraz
jednąsekwencjętrójnukleotydową.Utychszczepówleżąonewregionach
SSCL,odpowiedzialnychzafenotypowezmianyadaptacyjnetychbakterii
wodpowiedzinazmianyśrodowiskawzrostu[9–11].Powtórzeniaż-
nych,wtymszczególnieczteronukleotydowychSSR,wliczbieod3do30
iwięcej,sąnatomiastpowszechnedlawielugatunkówbakteriipatogen-
nychcharakteryzującychsięmałymigenomamiowielkościokoło2milio-
nówparzasad(H.influenzae,Neisseriameningitidis,Helicobacterpylori,
Campylobacterjejuni).WTabeli1Bprzykładowoprzedstawionolokaliza-
cjęniektórychsekwencjiSSRorazzmiennąliczbęichpowtórzeńwż-
nychlocigenomuH.influenzaeRborazN.meningitidis.
Ciekawychdanychdostarczyłydanedotyczącepolimorfizmu(zmian
wliczbiepowtórzeń)sekwencjiSSRwokreślonychhipermutatorowych
lociwgenomachszczepównależącychdotegosamegogatunku,ależ-
niącychsięstrukturągenetycznąipochodzeniem.Dlaprzykładu,liczba
powtórzeńczteronukleotydowejsekwencji5,CAAT-3,wgenieglikozylo-
transferazylic2wkolekcjiszczepówH.influenzaezróżnicowanychgene-
tyczniewahasięod5do57,awgeniehgpod6do43[12–14].Wyniki
innychbadań,przeprowadzonedlakolekcjiszczepówtegogatunkuizolo-
wanychzżnychźródeł,wskazują,żeliczbapowtórzeńSRRwokreślo-
nychregionachSSCLpodlega,znielicznymiwyjątkami,znaczniemniej-
szymwahaniom[15].Aczkolwiektrudnojestsformułowaćjednoznaczny
wniosekdotyczącyzmianliczbyokreślonychSSRwgenomachszczepów