Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
3.Analizametabolomu-zróżnicowanejchemiczniematrycy
zastosowalistrategięodciskupalcadowykazaniaróżnicwskładziemetabolomu
surowicykrwiosóbzdrowychicierpiącychnachorobęwieńcową.Zastosowano
chromatografięgazowąpołączonązespektrometriąmas.Ahmediwsp.zkoleiba-
dalizapomocątechnikiNMRmetabolityzwiązanezchorobąParkinsona,znajdu-
jąctakie,którychpoziomobniżałsię(np.bursztynian,malonian,metylamina)lub
wzrastał(np.inozytol,kwaspirogronowy)ubadanychpacjentówwporównaniu
zosobamizdrowymi.
19
Zagadnienia
1.Porównajzestawtechnikniezbędnychdoprzeprowadzeniaeksperymentu
metabolomicznegoiproteomicznego.
2.Omówtechnikiidentyfikacjiiinterpretacjidanychmetabolomicznychiprote-
omicznych.Jakieoprogramowaniestosujesięwkażdejstrategii?
3.Czymetodyprzygotowaniapróbekdocelówproteomicznychimetabolo-
micznychsątakiesame?Odpowiedźpoprzyjprzykładami.
Literatura
AhmedS.,SantoshW.,KumarS.,ChristletH.T.T.MetabolicprofilingofParkinson’sdisease:evidence
ofbiomarkerfromgeneexpressionanalysisandrapidneuralnetworkdetection.J.Biomed.Sci.16
(2009)63.
ChaceD.,KalasT.,NaylorE.W.Theapplicationoftandemmassspectrometrytoneonatalscreeningfor
inheriteddisordersofintermediarymetabolism.Ann.Rev.Genom.HumanGenet.3(2002)17–45.
FiehnO.Metabolomics–thelinkbetweengenotypeandphenotype.PlantMol.Biol.48(2002)
155–171.
terKuileB.H.,WesterhofH.V.Transcriptomemeetsmetabolome:hierarchicalandmetabolicregula-
tionoftheglycolyticpathway.FEBSLett.500(2001)169–171.
NicholsonJ.K.,LindonJ.C.Metabonomics23(10)(2008)1455.
VallejoM.,GarciaA.,TunonJ.,Garcia-MartínezD.,AnguloS.,Martin-VenturaJ.L.,Blanco-ColioL.M.,
AlmeidaP.,EgidoJ.,BarbasC.PlasmafingerprintingwithGC-MSinacutecoronarysyndrome.
Anal.Bioanal.Chem.394(2009)1517–1524.
VogelG.,FiehnO.,Jean-Richard-dit-BresselL.,BollerT.,WiemkenA.,AeschbacherR.A.,WinglerA.
TrehalosemetabolisminArabidopsis:occurrenceoftrehaloseandmolecularcloningandcharacte-
rizationoftrehalose-6-phosphatesynthasehomologues.J.Exp.Bot.52(362)(2001)1817–26.
WishartD.S.etal.HMDB:theHumanMetabolomeDatabase.Nucl.AcidsRes.35(Databaseissue)(2007)
D521-6.
