Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
1.3.Właściwościaminokwasów
9
naobdarzonesąładunkiem.Argininajestzasadąstosunkowomocnązewzględu
nastabilizacjęprzezrezonansładunkuprotonowanejgrupyguanidynowej;ztego
względuaminokwastenprzedstawiasięzwyklewjegoformienaładowanej.
Cociekawe,wprzypadkuhistydynypKazbliżonejestdowartościpHwży-
wychkomórkach.Dlategoteżładunekposzczególnychhistydynwbiałkuzależyod
drobnychwahańpHwokółwartościfizjologicznej(zwykleuważasię,żejestto7,4).
Wartozwrócićuwagę,żełańcuchyboczneasparaginyiglutaminyniesązasado-
we.Nieprotonowanagrupaamidowajestbowiemstabilizowanaprzezrezonans;efekt
stabilizującyznika,kiedygrupaulegaprotonowaniu.Podobniełańcuchbocznytryp-
tofanuzawieraukładaromatycznystabilizowanyprzezrezonansiwykazujezaled-
wiebardzosłabewłaściwościzasadowe.WwarunkachpH,przyjakichmożnabadać
białka,należyprzyjąć,żełańcuchbocznytryptofanupozbawionyjestcechzasady.
1.3.3.Właściwościfizyczne
Wtabeli1.1podzielonoaminokwasyzewzględunatypchemiczny.Równieważna
jestklasyfikacjauwzględniającawłaściwościhydrofiloweihydrofobowełańcu-
chówbocznych,czyliichpowinowactwodowody.Jesttocechaokapitalnymzna-
czeniudlasposobuzwijaniasiębiałekiprzyjmowaniaprzezniezwartejstruktury
przestrzennej;wrócimydotegoproblemuwrozdziale5.
Komentarz1.3.Hydrofobowość
Hydrofobowośćtopojęciedośćulotne,choćczęstoprzejawiającesięwcałkiem
namacalnysposób.Jeślinaprzykładdowodywlejemyniewielkąilośćoliwy
(awięcmieszaninytriglicerydów),nierozpuścisięona,leczutworzyodrębne
kropelki.Wyjaśniająctozjawisko,mówisięooddziaływaniachhydrofobowych
międzyniepolarnymicząsteczkamitriglicerydów;uważasię,żeoddziałująone
wkorzystnysposóbzesobą,aleniezcząsteczkamiwody.Wwyjaśnieniutym
chodziprzedewszystkimoentalpiętychoddziaływań.Niejesttojednakpo-
glądprawidłowy:mamytubowiemdoczynieniagłówniezefektementropowym.
Cząsteczkatrigliceryduwwodzieotoczonajestuporządkowanąwarstwącząste-
czekH2O.Jeślitęcząsteczkęprzeniesiemyzwodydokropelkitłuszczu,znika
skrępowaniejejruchówcząsteczkamiwody,czemutowarzyszywzrostentropii
układu.Zasadniczotenwłaśniewzrostentropiijestsiłąnapędowątzw.oddzia-
ływańhydrofobowych.Szczegółowyopisefektuhydrofobowegoznaleźćmożna
wksiążceTanforda[3].
Niejestłatwowyrazićwłaściwościhydrofiloweihydrofoboweaminokwasów
wsposóbilościowy.Wielokrotniebadanoilościowopodziałpochodnychamino-
kwasówlubpochodnychichłańcuchówbocznychmiędzywodęarozpuszczal-
nikiorganiczne;pomiarytepozwalająstworzyćrozmaiteskalehydrofobowości,
aleotrzymanerezultatyzależądopewnegostopniaodszczegółowychwłaściwo-
