Treść książki

Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
II.2.Genomczlowieka
15
cząsteczceDNA,ajegowielkośćstanowiokoło
0,0005%genomujądrowego.Genomjądrowyliczy
ponad3miliardynukleotydówijestpodzielonyna
24chromosomy.Genomyjądrowyimitochondrial-
nyróżniąsięnietylkoumiejscowieniemwkomórce,
wielkością,liczbąirodzajemkodowanychgenów,
alepodlegająrównieżodmiennymzasadomdzie-
dziczenia.Informacjeogenomiemitochondrialnym
zamieszczonowrozdziałachopisującychzasady
dziedziczenia,chorobymitochondrialneianalizę
DNAwmedycyniesądowej.
II.2.1.Genomika
PocząteklatdziewięćdziesiątychXXwiekuprzy-
niósłdecyzjedotyczącepełnegopoznaniagenomu
człowieka.Tenświatowyprogrambyłkoordyno-
wany
przez
Human
Genome
Organization
(HUGO).Skalęprzedsięwzięcia,natamtelata,
mogązobrazowaćnastępująceinformacje.Do
końca1997rokutylkodlakilkubakterii,wtym:
M.genitalium(0,58Mpz),Haemophilusinfluenzae
(1,83Mpz),Methanococcusjannaschii(2Mpz),
Staphyloccocusaureus(2,8Mpz),udałosiępoznać
pełnągenomowąsekwencjęnukleotydów.Wge-
nomieM.genitaliumzidentyfikowano517genów,
wgenomieH.influenzae1743,awS.aureus2400.
Wporównaniuztymiorganizmamigenomczło-
wiekajestwiększyotrzyrzędywielkości(tab.
II-4)1,aliczbękodowanychwnimgenówszacuje
sięnaokoło25tysięcy.
Przyspieszeniepracnadsekwencjonowaniem
genomuludzkiegobyłozwiązanezzaangażowa-
niemkapitałuprywatnego.Do1995rokuwludz-
kichbankachgenówznajdowałosięniespełna
12Mpzsekwencjinukleotydowych,costanowi
około0,4%całegogenomu.Tylko19spośród
znanychsekwencjiDNAmiałowiększądługośćniż
50kpz.Postępdokonanywciągu1996rokubyłsto-
sunkowoniewielki.Znanabyłasekwencjaokoło
1%genomu.W1999rokuznanychjużbyło
188,9Mpz,costanowiło6,3%całegogenomu.
W2000rokuopublikowanoprawiepełnąsekwen-
cjędwóchnajmniejszychchromosomówczłowie-
ka:21i22.Zapowiedzianoopublikowaniesekwen-
cjiDNAchromosomów5,16i19.Podanorównież
informacjęozakończeniupracnadrobocząwersją
genomu.
Ustalonyzapisrodzajuikolejnościnukleotydów
wcząsteczceludzkiegoDNAmiałcharaktermode-
lowy.Możnasięspodziewać,żewkrótkimczasiepo
2010rokusekwencjanukleotydówwgenomowym
DNAbędzieznanadlasetekosób.Poznaniero-
dzajuizakresuistniejącychróżnicumożliwimiędzy
innymipełnącharakterystykęgenomu:określenie
dodatkowychmarkerówgenetycznychprzydatnych
wmapowaniugenów,wbadaniachzzakresupato-
logiimolekularnejiwbadaniachprognostycznych.
Wramachtegotypuprojektówprzewidujesię
podjęciesystematycznychbadańgrupetnicznych
ipopulacjiizolowanych.
Rok2000zaowocowałopublikowaniemsekwencji
genomowej30organizmów,wtymnicieniaCaeno-
rhabditiselegans(97Mpz)irzodkiewnikaArabido-
psisthaliana(125Mpz).W2005rokupoznaliśmy
międzyinnymisekwencjęgenomupsaiszympansa.
W2010rokuznanejużbyłygenomyponad200
organizmów(http://www.genomesize.com/),wtym
25samychtylkoróżnychgatunkówssaków.
(http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_sequenced_
eukaryotic_genomes).Poznaliśmyrównieżgenom
neandertalczyka.
Wynikomidentyfikacjisekwencjikolejnychge-
nomówtowarzyszynapływolbrzymiejilościinfor-
macji.Częściowąodpowiedziąnakonieczność
przetwarzanianapływającychdanychzarówno
TabelaII-4.Liczbagenówkodującychbialkauróżnychorganizmów
Wielkośćgenomu
´10
6pz
Gatunek
Escherichiacoli
4,63
Saccharomycescerevisiae
14
Drosophilamelanogaster
170
Homosapiens
3000
Liczba
chromosomów
Średniawielkość
genu(kpz)
Liczbagenów
1
1,2
3025
16
1,7
6702
8
11,3
ok.13000
46
16,3
ok.25000
1Pierwszymgenomem,jakiwpełnizsekwencjonowano,byłliczący5386pzchromosombakteriofagaFX174(1977r.),kolejnym
byłzłożonyz48502pzgenombakteriofagal(1982r.).