Treść książki

Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
30
2.Podstawygenetykiigenomiki
Rycina2.20.ObrazłamliwegochromosomuXq27.3.PolewejstroniechromosomywybarwioneodczynnikiemGiemsy,
natomiastpoprawejtechnikąprążkowegobarwieniaGTGumożliwiającąidentyfikacjęchromosomuX
doklasyfolianowrażliwychmiejscłamliwych,tzn.takich,
czteroramiennychlubbardziejzłożonychkonfiguracjichro-
którychwarunkiemekspresjicytogenetycznejjestniedobór
mosomów.Jeślidwazłamaniaprowadzącedowymiany
kwasufoliowegoitymidynywpodłożuhodowlanymkomó-
powstanąwtymsamymlocusnaobuchromatydachjednego
rek(ryc.2.20).Podłożemmolekularnymłamliwościtych
chromosomu,towymianychromatydsiostrzanych
miejscjestwydłużenieniestabilnych,trójnukleotydowych
(ang.sisterchromatidexchange,SCE).Mogąbyćone
sekwencjiDNAwobrębiegenówodpowiedzialnychzacho-
uwidocznionepodmikroskopemtylkopozastosowaniu
robę(por.mutacjedynamiczne).Wwiększościprzypadków
specyficznychtechnikzróżnicowanegowybarwianiachro-
zawystąpieniezespołułamliwegochromosomuXjestodpo-
matydsiostrzanychchromosomu(ryc.2.22).
wiedzialnewydłużenieniestabilnejsekwencji(CGG)n
Aberracjechromatydowe,wodróżnieniuodkonsty-
wpierwszymeksoniegenuFMR1imetylacjapobliskiej
tucyjnychaberracjichromosomowych,należądonaby-
wyspyCpG.MiejscełamliweFRAXAjestcytogenetycznym
tych.Mogąpowstawaćpodwpływemróżnychczynników
przejawemtegotypumutacji.Obecnieprzypuszczasię
mutagennych(np.promieniowaniajonizującego,muta-
także,żepospolitemiejscałamliwe,jakoregionyszczególnie
genówchemicznychczyinfekcjiwirusowych).Stanowią
wrażliwenazaburzeniareplikacjiDNA,uczestnicząwroz-
teżprzedmiotbadańcytogenetycznychwdiagnostyce
wojuprocesunowotworowegoiniestabilnościgenomu
zespołówogenetycznieuwarunkowanejniestabilności
wkomórkachnowotworowych.Utrataheterozygotyczności
chromosomów.
idużedelecjewobrębietychmiejscłamliwych[np.FRA3B
(3p14.2)iFRA16D(16q23.2)]skutkująinaktywacjąmapu-
jącychsięwnichgenówsupresorowych(FHITczyWWOX).
2.3.3.Polimorfizm
Stwierdzanotowwielutypachnowotworów(płuc,nerek,
Wzajemnewystępowaniewykluczającychsięformstruk-
przewodupokarmowego,piersi,prostatyiinnych).
turalnychjednegolubkilkuchromosomówjestokreślane
Aberracjechromatydowe.Stanowiąodrębnągrupęaber-
jakopolimorfizmchromosomów.Napoziomiegenuzmia-
racji,którezdefinicji,wodróżnieniuodaberracjitypuchro-
namipolimorficznymiokreślasięjednoczesnewystępowa-
mosomowego,dotycząuszkodzeńizmianwpojedynczych
niewpopulacjiróżnychformallelicznychdanegogenotypu.
chromatydachchromosomów.Powstająwczasiereplikacji
Wświetledzisiejszejwiedzyzmianpolimorficznychnie
DNAlubporeplikacji,tzn.wfazieSlubG2cyklukomór-
pomijasięprzyrozpatrywaniuznaczeniaklinicznego.
kowego.Wnastępnymcyklu(wkomórkachpotomnych)
Arbitralnieprzyjęłosięuważaćzazmianępolimorficzną
aberracjechromatydowestająsięaberracjamichromosomo-
takiwariant,którywpopulacjiwystępujeczęściejniżw1%.
wymi.Wśródaberracjichromatydowychwyróżniasięmiej-
Polimorfizmmożedotyczyćpojedynczegonukleotydu,
scaniebarwiącesię,tzw.przerwychromatydowe(ang.gap)
powtarzającegosięmotywusekwencji,atakżeliczbykopii
orazzłamaniaiwymianychromatydowe(ryc.2.21).Nie
fragmentuDNA.
wchodzącwszczegółoweomawianierozmaitychtypów
PolimorfizmpojedynczegonukleotyduwsekwencjiDNA
wymian,ogólniemożnajepodzielićnatakie,którepowstają
określasięjakoSNP(ang.single-nucleotidepolymorphism).
międzydwiemachromatydamijednegochromosomu,lub
SNPnajprościejwykrywasię,sekwencjonującDNA.Może
takie,któredotycząchromatyddwóchlubkilkuchromoso-
byćidentyfikowanyrównieżzwykorzystaniemtechnikprze-
mów.Wymianychromatydmiędzykilkomachromosomami
siewowych,takichjakSSCP(ang.single-strandconformation
powodująpowstaniecharakterystycznychtrójramiennych,
polymorphism),DGGE(ang.denaturinggradientgel