Treść książki

Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
2.2.Genomczłowieka
15
prywatnego.Do1995r.wludzkichbankachgenówznaj-
odpowiadającychzabiochemięifizjologiękomórki.Oznacza
dowałosięniespełna12Mpzsekwencjinukleotydowych,
torównocześniebadanieekspresjiwielugenównapozio-
costanowiokoło0,4%całegogenomu.Tylko19spośród
mietworzonychtranskryptów(analizatranskryptomu).
znanychsekwencjiDNAmiałowiększądługośćniż50kpz.
Kompleksowymibadaniamiekspresjibiałekiichwzajem-
Postępdokonanywciągu1996r.byłstosunkowonie-
nychoddziaływańzajmujesięzkoleiproteomika.Niespo-
wielki.Znanabyłasekwencjaokoło1%genomu.W1999r.
sóbwtymkontekścieniewymienićbioinformatyki,atakże
znanychjużbyło188,9Mpz,costanowiło6,3%całego
badańinsilico,któresamewsobiestanowiąwydzielonądzie-
genomu.W2000r.opublikowanoprawiepełnąsekwen-
dzinęumiejętności.
cjędwóchnajmniejszychchromosomówczłowieka:21i22.
mów5,16i19.Podanorównieżinformacjęozakończeniu
2.2.2.Strukturagenomu
ZapowiedzianoopublikowaniesekwencjiDNAchromoso-
pracnadrobocząwersjągenomu.
Początkowetrudnościwsekwencjonowaniugenomuczło-
Ustalonyzapisrodzajuikolejnościnukleotydówwczą-
wiekaodzwierciedlaływpewnymstopniuzróżnicowa-
steczceludzkiegoDNAmiałcharaktermodelowy.Znamy
niejegostruktury(tab.2.5).Szczególniepoznaniedługich
jużzapissekwencjinukleotydówwgenomiedlatysięcy
powtarzającychsięsekwencjinukleotydów,niezależnieod
osób.Trwająpracenadidentyfikacjąróżnicmiędzyoso-
przyjętejstrategiisekwencjonowania,odwlekłomoment
bami,tj.próbystworzeniamapywariantówsekwencyjnych.
opublikowaniapierwszegopełnegozapisuinformacji
Poznanierodzajuizakresuistniejącychróżnicumożliwi
genetycznej.
międzyinnymipełnącharakterystykęgenomu:określe-
niedodatkowychmarkerówgenetycznychprzydatnych
Tabela2.5.Strukturagenomuczłowieka
wmapowaniugenów,wbadaniachzzakresupatologiimole-
kularnejiwbadaniachprognostycznych.Wramachtego
Częśćgenomu
Typsekwencji
(%)
typuprojektówprzewidujesiępodjęciesystematycznych
badańgrupetnicznychipopulacjiizolowanych.
Unikatowe(genykodującebiałka)
~1,5
Rok2000zaowocowałopublikowaniemsekwencjigeno-
GenyRNA
~4
mowej30organizmów,wtymnicieniaCaenorhabditis
elegans(97Mpz)irzodkiewnikaArabidopsisthaliana
Powtórzone
~45
(125Mpz).W2005r.poznaliśmymiędzyinnymisekwencję
Inne
~50
genomupsaiszympansa.W2010r.znanejużbyłygenomy
ponad200organizmów(http:llwww.genomesize.coml),
wtym25samychtylkoróżnychgatunkówssaków(http:ll
Sekwencjeunikatowe,wśródktórychznajdująsięgeny
en.wikipedia.orglwikilList_of_sequenced_eukaryotic_geno-
kodującebiałka,stanowiąjedynieokoło1,5%całego
mes).Poznaliśmyrównieżgenomneandertalczyka.
genomu.Sekwencjetetoswoistegorodzajuwyspywmorzu
Wynikomidentyfikacjisekwencjikolejnychgenomów
sekwencjitylkoczęściowoznanejfunkcji.Rzadkospotyka
towarzyszynapływolbrzymiejilościinformacji.Częściową
sięzgrupowaniagenów,takichjaknp.kodująceryboso-
odpowiedziąnakoniecznośćprzetwarzanianapływają-
mowyRNA.Genytewystępująbowiemwblokachwpięciu
cychdanychzarównonowetechnologie,jakipowstanie
chromosomachczłowieka.
odrębnejgałęzigenetykimolekularnej,jakąjestgenomika.
Sekwencjepowtórzone,toznaczywystępującewgenomie
Genomikaporównawczajużobecnieprzynosiodpowiedź
wwielukopiach,charakteryzująsięokreślonąwielkością,
nawielepodstawowychpytańzzakresuewolucjigenomu,
rodzajemiukłademnukleotydów.Stanowiąoneokoło
pochodzeniairoliposzczególnychgenów.Celemgeno-
40%genomu.Sekwencjetezregułyniekodująbiałek.
mikifunkcjonalnejjestbadanienietylefunkcjidanego
Wyróżniasięwśródnichsekwencjerozproszoneisekwencje
genu,ileorganizacjiikontrolidrógmetabolicznych
tandemowe(ryc.2.6).
Sekwencjepowtórzone
Rycina2.6.Rodzajesekwencjipowtórzonych