Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
1.Białka:konformacja,pojemnośćcieplna
1.1.Stankonformacyjnybiałka
Natywnastrukturabiałkareprezentujerównowagęenergetycznąróżnego
typuoddziaływańmiędzygrupami(fragmentami)makromolekułyorazmiędzy
tymigrupamiiotaczającymśrodowiskiem,zwyklewodą.Formanatywna
białkamakonformacjęnajbardziejstabilnąenergetycznie.Należyzdawaćsobie
sprawęztego,żeopisaniestanunatywnegojakoposiadającegojednąkonfor-
macjęjestuproszczeniem.Bardziejrealistycznewyobrażenietegostanutoze-
staw(klaster)strukturalniepodobnychkonformacjilubstanglobalny,
mieszczącywsobiemałą,aleznaczącąliczbęmikrostanów.
Opisującstankonformacyjnybiałkawjęzykumechanikistatystycznej,moż-
nazałożyć,żemikrostanmakonformację,którajestzdefiniowanazdużymi
szczegółami,tzn.żemogąbyćznanepozycjewszystkichatomówmakromole-
kułyikątywszystkichrotującychwiązań.Mikrostanyprzekształcająsięgwał-
townieistanglobalnyodzwierciedlaśredniezachowaniesiętychmikrostanów.
EnergięswobodnąGibbsaG(entalpięswobodną)układuzawierającegoN
niezależnychmolekułmożnawyrazićjako:
G
=-
kT
ln(
Q
N
),
(1.1)
gdzie:Qjestsumąstatystyczną(funkcjąpodziału),kTjestiloczynemstałej
Boltzmannaitemperatury.Qjestsumąstatystycznąpozbiorzemikrostanów
włączonychwjedenstanglobalny:
Q
=
å
n
i
GS
e
-
E
i
/
kT
,
(1.2)
13
