Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
22
Proteomikaimetabolomika
separacjaposzczególnych
składników
przygotowaniepróbki
identyfikacjabiałek
walidacjaprzeciwciałami
selekcjapotencjalnych
biomarkerów
Rys.4.2.Ogólnymodelpostępowaniawbadaniachproteomicznych
Przyjętastrategiazależyodwieluczynników,wtymodrodzajumateriału
biologicznegoiceluanalizy.Wzwiązkuztymprocedura,jakisposóbprzygoto-
waniapróbkimusząbyćopracowywaneindywidualnie.Zastosowanametodyka
narzucadalszeetapypostępowania,wzwiązkuzczymkażdorazowopowinna
byćdokładnieprzemyślana.Jesttoszczególnieistotnewprzypadkuproteomiki
porównawczej,którejzadaniemjestidentyfikacjaróżnicmiędzyprofilamibiałko-
wymiorganizmów.
Typowysposóbpostępowaniazpróbkąbiologicznąskładasięzkilkupod-
stawowychetapów(rys.4.2).Protokółpowinienzawieraćichjaknajmniej,gdyż
każdadodatkowaczynnośćmożepowodowaćutratęmateriałuipowstawanie
artefaktów.
4.2.Pobranieiprzechowywaniemateriału
Odmomentupobraniamateriałbiologicznynależyprzechowywaćwniskiej
temperaturze,najlepiejponiżej-80OC.Przechowywaniepróbekwzamrażalniku
lodówki(temp.ok.-15OC)niespełniakryteriówwymaganychwanalizieprote-
omicznej,gdyżmateriałulegaszybkiejdegradacji,zpowoduobecnościenzymów
proteolitycznych.Ważnejest,abypreparatpodzielićnaodpowiednieporcje,nie
narażającgonawielokrotnerozmrażanieizamrażanie.
Podstawowymiźródłamipróbekbiologicznychwproteomiceimetabolo-
micesą:narządyoraztkankizwierzęceiroślinne,hodowlekomórkowe,płyny
ustrojowe(krew,osocze,płynmózgowo-rdzeniowy,ślina),chirurgicznewycinki
tkanek,bakterieorazwirusy.Należyzachowaćszczególnąostrożnośćzarów-
nopodczaspobieraniamateriału,jakipracyznimorazutylizacjipozostałości.
Pobieraniemateriałubiologicznegowymaganajczęściejuzyskaniapozwolenia
odpowiednichkomisjibioetycznych,awszczególnościwyrażeniazgodyprzez
osobybadane.
