Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
METODYBIOLOGIIMOLEKULARNEJWIDENTYFIKACJIZMIANGERMINALNYCHISOMATYCZNYCHWCHOROBACHPŁUC
18
ZestawienietechnikanalizyDNAwykorzystywanychwbadaniachchoróbpłuc
Zastosowaniewdiagnostyce
Materiał
Granica
Wady
Zalety
Test
choróbpłuc
badany
wykrywalności*
Identyfkacjawariantów
Umożliwiawykrywanie
Łatwedowykonania,niskie
somatycznych:analizagenów
pojedynczychzmian
wymaganiasprzętowe,
NRAS
,
KRAS
,
BRAF
,
EGFR
stosunkowoniskacena,bardzo
DNA,ctDNA
1-0,02%
qPCR(ASO-PCR)
szybkiczasoznaczenia(2-3
godz.)
Identyfkacjawariantów
Wymaganyjestspecjalistyczny
Bardzowysokaczułość,
somatycznych-przede
sprzęt,dosyćpracochłonne
możliwośćdokładnego
wszystkimtestydoidentyfkacji
wzestawieniuzqPCR,
określenialiczbykopii
ctDNA
1-0,001%
ddPCR
wariantówopornościowych
umożliwiawykrywanietylko
zmutowanychalleli(kopie/ml)
)
EGFR
(np.p.The790Metwgenie
pojedynczychzmian
Identyfkacjawariantów
Tylkodoanalizyokreślonych
Relatywnieniedroga,łatwado
germinalnych,np.analizagenów
genów/fragmentówgenów,
wykonania,niskiewymagania
DNAI1
,
DNAH5
,
CFTR
wymaganeDNAwysokiej
sprzętowe
DNA
Brakdanych
MLPA
jakości
,
MET
Ocenaamplifkacjigenu
Relatywnieniskaczułość,
Relatywnietania,duża
,
ALK
ocenafuzjigenowychm.in.
subiektywnaocena,brak
dostępność,powszechnie
Wymaganiemniej
RET
,
ROS1
jasnychstandardówoceny
znana,możliwośćoceny
DNA
niż100komórek
FISH
wyników
amplifkacjiifuzjigenowych
nowotworowych
TABELA1.
