Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
Rys.2.11.Planarnośćwiązaniapeptydowego
istniejądużemożliwościswobodnejro-
tacjipoobustronachsztywnegoukładu
Rys.2.10.Rozmiarywiązańikątówwugrupowaniu
(Reprodukowano,zazgodą,z:
peptydowym
TheAnnualReviewofBio-
ugrupowaniapeptydowego,aokreślanej
odpowiedniokątamitorsyjnymi:•(fi)—
chemistry
,vol.50,p.502,fig.2[19],©1981by
Annual
wokółwiązaniaNłC|i—(psi)—wokół
Reviews,Inc
.,PaloAlto,CA)
wiązaniaC|łC′.Obrótwokółwiązania
C′łNoznaczonyjestprzez˜.c)Kąty
określiłyprzedewszystkimzasadybu-
międzywiązaniamitychatomówsąściśle
dowymaksymalnierozciągniętegołań-
określone(zgodniezrys.2.10)ijedna-
cuchapolipeptydowego,uwidocznione
kowewprzypadkuwiązańpeptydowych
narys.2.10.
tworzonychprzezróżneaminokwasy.
1)Wszystkiewiązaniapeptydowesą
2)Czteryatomywiązaniapeptydo-
równocenne,niezależnieodtworzących
wego>C”Oi>NłHorazsąsiadują-
jeL-0-aminokwasów.a)Odległośćmię-
cewęgle0leżąwjednejpłaszczyźnie.
dzyatomamiwęglaiazotutworzącymi
Szkieletłańcuchapeptydowegomożebyć
wiązaniapeptydowe(amidowe)wynosi
przedstawionyjakoszeregwzględnieszty-
0,133nm,costanowiwartośćpośrednią
wnychpłaszczyzn,oddzielonychodsiebie
pomiędzydługościamiwiązań:pojedyn-
grupamiłCHR[P49,s.111](rys.2.11).
czegoŤCłN”(0,149nm)ipodwój-
3)Planarnośćugrupowaniapeptydo-
nego>C”Nł(0,127nm)[P75,s.40].
wegostwarzamożliwośćwystępowania
Natomiastwiązanie>C”Ojestwydłu-
konfiguracjicisitrans.Bardziejkorzystna
żonez0,121do0,124nm[11].Wiązanie
energetyczniejestkonfiguracjatrans,
peptydowewykazujewznacznymstopniu
tzn.taka,którejodpowiadaminimum
właściwościwiązaniapodwójnego,co
energiipotencjalnej.Wistociereszty
uniemożliwiaswobodnąrotacjęijakikol-
aminokwasoweprzysasiadującychwęg-
wiekobrótgrupy>NłHwstosunkudo
lach0sąrozmieszczonenaprzemianpo
>C”Owymaganakładuenergii.Kąt
obustronachpłaszczyznyłańcuchapoli-
obrotuwokółwiązaniapeptydowego
peptydowego.Podobnieatomywodoru
ŤCłN”oznaczasięjako˜(omega)
grupyiminowejitlenugrupykarbonylo-
inazywasiękątemdeformacji[P51,
wejwiązaniapeptydowegoznajdująsię
s.179].b)Odległościmiedzywęglem
wstosunkudosiebiewpołożeniutrans.
0aatomemazotugrupyaminowejoraz
4)Okresidentyczności0,98nmjest
atomemwęglagrupykarbonylowej(C′)
charakterystycznydlaosipoprzecznej
sąbliskie0,15nm(dokładnie0,146
szkieletupeptydowegozłańcuchamibo-
i0,151nm,odpowiednio).Wiązaniamię-
cznymiresztaminokwasowych.
dzywymienionymiatomamisątypowymi
5)Długość
odcinka
zajmowanego
wiązaniamipojedynczymi,wokółktórych
przezdwieresztyaminokwasowezwią-
38
