Treść książki

Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
2.1.Podstawygenetykimolekularnej
11
rozpoznajesekwencjepromotorowegenudziękipodjed-
nostcensigma”
.
Eukariotycznypromotorskładasięzkilkuczęściregu-
latorowych.Miejscestartutranskrypcjipoprzedzapromo-
torrdzeniowypełniącyfunckjępodobnądopromotora
bakteryjnego.Wobrębieczęścirdzeniowejwystępujenaj-
częściejsekwencjabogatawparyAT(TATA-box)oraz
sekwencjaCAAT(CAAT-box).Innesekwencjeregu-
lacyjneumiejscowionepozardzeniempromotora.
Należądonich:wzmacniacze(ang.enhancers)iwycisza-
cze(ang.silencers).Regionyregulacyjnemogąbyćpoło-
żonewznacznejodległości,niekiedynawetkilkutysięcy
nukleotydów,odczęścikodującejgenu.Rozpoczęciepro-
cesutranskrypcji,jegoszybkośćiczastrwaniaregulo-
waneprzezbiałkoweczynnikitranskrypcyjneprzyłączające
siędosekwencjiregulatorowych.UEukaryotasekwencja
promotoraniejestbezpośredniorozpoznawanaprzezpoli-
merazę,leczprzezwspomnianeczynnikitranskrypcyjne.
Zapoczątkowywanyjestwtensposóbkomplekstran-
skrypcyjny,któryobokpolimerazyRNAskładasięzokoło
50białek.Znajdująsięwnimbiałkarozpoznającesekwen-
cjęTATA,specyficzneaktywatory,represoryspowalniające
transkrypcjęitp.Eukariotycznansigma”jestwięckomplek-
sembiałkowym.
Opisanemusystemowiregulacjitranskrypcjiniepodlega
pewnaklasagenów,zwanychgenamimetabolizmupodsta-
wowego(ang.housekeepinggenes),którychproduktynie-
zbędnedociągłegoprzebieguprocesówżyciowychkomórki.
Wgenachtychpolimerazarozpoczynatranskrypcjęodsek-
wencjibogatejwparyGCrozpoznawanejprzezczynnik
transkrypcyjnySP1.
Systemregulacjidziałaniagenówmożemiećstrukturę
hierarchiczną.Najbardziejjesttowidocznewprocesach
genetycznejregulacjiróżnicowaniasięorganizmówtkan-
kowych.Każdyorganizmzwierzęcypowstajezpojedynczej,
zapłodnionejkomórkijajowej,któradzielącsięwielokrotnie,
różnicujesię,tworzącwpełniukształtowanyorganizmzło-
żonyzodmiennychiróżnieumiejscowionychtkanek.Jaksię
wydaje,genykierująceprocesemróżnicowania(np.geny
homeotyczne)podobnezarównoubezkręgowców,
jakikręgowców.Prawidłowafunkcjagenówhomeotycznych
poleganaprzypisaniukomórkom,znajdującymsięwróżnych
częściachtworzącegosięorganizmu,określonejorientacji
przestrzennej.Wydajesię,żeliniowyporządekwystępujących
wblokachgenówhomeotycznych(od5!do3!)odpowiada
osiowemuporządkowiróżnicującegosięorganizmu(typu
głowa-ogon).Produktamigenówhomeotycznychbiałka
wiążącesięzDNA,uczestniczącewprocesieregulacjigenów.
Oileopisywanemechanizmyregulacjitranskrypcjidoty-
czyłykonkretnychgenówczyteżichfragmentówregulatoro-
wych,otylemetylacjaDNAniejesttakspecyficzna,dotyczy
bowiemsekwencjiwystępującychwgenomiebardzoczęsto.
Możewięcdotyczyćregulacjigrupygenów,anawetcałego
chromosomu(inaktywacjajednegozchromosomówX).
Metylacjazaliczanajestdotzw.mechanizmówepigenetycz-
nych;termintenstworzonopoczątkowojedyniedlatejczę-
ściregulacji,którajestzwiązanazrozwojemzarodka.Proces
metylacjildemetylacjiDNAjestpowiązanyzinnymiregu-
lacyjnymimechanizmamiepigenetycznymi,takimijaknp.
acetylacjaldeacetylacjahistonów,wwynikuktóregonastę-
pujązmianystrukturychromatyny,coumożliwialubblo-
kujeaktywnośćtranskrypcyjnąposzczególnychfragmentów
chromosomów.
Pozakończeniutranslacjiwielebiałekprzechodziswoi-
stąpotranslacyjnąmodyfikację,polegającąmiędzyinnymi
nametylacji,fosforylacjilubglikozylacjicząsteczki.Liczne
białkasyntetyzowanewformieprekursorów.Wtymprzy-
padkumodyfikacjapoleganaodcięciufragmentupeptydu.
Potranslacyjnamodyfikacjamożemiećrównieżcharakterswo-
istegoprocesuskładaniabiałka,analogicznegodoskładania
RNA.Wykazano,żeniektórepeptydymajązdolnośćautoka-
talitycznegousuwaniazeswojejstrukturyfragmentówzwa-
nychinteinami(analogiadointronów).Trudnopowiedzieć,
jakpowszechnyjesttoprocesijakiefunkcjepełniąwkomórce
inteiny.Niewątpliwieprocesskładaniabiałkazwiększaróżno-
rodnośćproduktówkodowanychprzezdanygen.
Prawidłowafunkcjabiałkajestzwiązanazprzyję-
ciemodpowiedniejstrukturydrugo-itrzeciorzędowej.
Doniedawnapanowałoprzekonanie,żepełnainformacja
oprawidłowympofałdowaniubiałkajestzawartawsek-
wencjinukleotydówkodującychodpowiednieaminokwasy.
Mówiononawetodrugimkodziegenetycznym.Okazałosię
jednak,żedoprzyjęciawłaściwejkonformacjiniezbędnajest
obecnośćspecyficznejklasybiałek.Wśródnichwyróżnia
sięenzymykatalizującefałdowanieorazbiałkaopiekuńcze
(towarzyszące)(ang.chaperone).Opisanokilkaklastychbia-
łek.Białkaopiekuńczeułatwiająwłaściwefałdowanieinnych
białek,aleniejesttoprocesaktywny.Nietowarzyszymu
powstawaniewiązańkowalencyjnych,białkateniewcho-
dząrównieżwskładfałdującychsiępolipeptydów.Białka
opiekuńczebiorąudziałtakżewewszystkichetapachmeta-
bolizmukomórkowego,wochronieprzedstresem(np.pod-
wyższeniemtemperatury),atakżewnnaznaczaniu”białek
przeznaczonychdodegradacji.Charakteryzująsięmiędzy
innymidużąkonserwatywnościąsekwencjiaminokwasów.
Swoistymmechanizmemregulacjiekspresjigenujest
tzw.wyciszanie.Wyciszanieekspresjidanegogenumożesię
dokonaćpoprzezdegradacjętranskryptu,blokowanietrans-
lacjilubindukcjęmechanizmówepigenetycznych,takichjak
metylacjaDNA.
2.1.3.1.Wyciszanieekspresjigenu
Jednazpostacipotranskrypcyjnegomechanizmuwyciszania
ekspresjigenówjestnazywanainterferencjąRNA(ang.RNA
interference,RNAi).Szczególnąrolęwtymprocesiepełni
klasacząsteczekRNAzaliczanychdoniekodującegoRNA
(niekodującychbiałek)(ang.noncodingRNA,ncRNA).