Treść książki

Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
16
2.Podstawygenetykiigenomiki
Tabela2.6.Podstawowesymbolestosowanedoopisu
kariotypu(ISCN,2016)
add
dodatkowymateriałchromosomowynieznanego
pochodzenia
centromer
delecja
pochodnaprzegrupowaniachromosomowego
chromosomdicentryczny(zawierającydwa
centromery)
denovo,aberracjachromosomowa,któraniezostała
odziedziczona
duplikacja
miejscełamliwe
heterochromatyna
izochromosom
insercja
inwersjalubodwróconaduplikacja
chromosommarkerowy
pochodzeniematczyne
mozaikowy
krótkieramięchromosomu
pochodzenieojcowskie
długieramięchromosomu
chromosompierścieniowy
chromosomzrekombinowany
translokacjarobertsonowska
satelity
regionsubtelomerowychromosomu
translokacja
terminalnylubtelomer
disomiajednorodzicielska
wariantlubzmieniony
przednumeremchromosomuoznaczadodanie
lubutratęcałegochromosomu,ponumerze
chromosomuoznaczadodanielubutratęjegoczęści
złamaniechromosomu
złamanieiponownepołączenie
określaopisywanyfragmentchromosomunod-do”
cen
del
der
dic
dn
dup
fra
h
i
ins
inv
mar
mat
mos
p
pat
q
r
rec
rob
s
subtel
t
ter
upd
var
+/-
:
::
->
Sekwencjerozproszonedzielisięzkoleinasekwencje
krótkieidługie.Sekwencjekrótkie(ang.shortinterspersed
nuclearelement,SINE),odługości130-300nukleotydów,
rozproszonewtysiącachkopiiwcałymgenomie.Naprzyk-
ładsekwencjaAluodługościokoło300nukleotydówjest
nporozrzucana”pogenomiew1milioniekopii.Sekwencjata,
zaliczananiekiedydotranspozonów,czylielementówzdol-
nychdoprzemieszczaniasiępogenomie,stanowiłącznie
około10%całegogenomu.Jejwystępowaniejestcharak-
terystycznedlanaczelnychi,jaksięwydaje,możebyćona
podatnanaredagowanieRNA.SekwencjęAluzlokalizo-
wanorównieżwintronachgenówkodujących0-i;-globinę,
hormonwzrostuczyapolipoproteinęB.Wliczącym17kpz
genieinhibitoraC1(mutacjetegogenuodpowiedzialne
zadziedzicznyobrzęknaczynioruchowy)zlokalizowano
17sekwencjiAlu.
Długiesekwencjerozproszone(ang.longinterspersed
nuclearelement,LINE),owielkościokołokilkutysięcy
nukleotydów,reprezentują,podobniejaksekwencjaAlu,
klasęsekwencjipochodzącychodtranspozonów.Szacuje
się,żestanowiąoneokoło20%genomu.
Sekwencjetandemowe,nazywanerównieżsatelitar-
nymi,tozblokowaneseryjnepowtórzeniakrótkiejsekwen-
cjinukleotydów.Dzielisięjenaminisatelityimikrosatelity,
któreróżniąsięmiędzysobąliczbąnukleotydówzawartych
wpowtarzającymsięmotywie.Nazwansekwencjesateli-
tarne”pochodziodjednorodnej(satelitarnej)frakcjiDNA
obserwowanejwgradientachgęstościwczasiefrakcjonowa-
niagenomowegoDNA.
Minisatelitytozblokowane,zwielokrotnionekopie,wktó-
rychpowtarzającysięmotywzawieraod10do100nukleo-
tydów.Szacujesię,żewgenomieczłowiekaznajdujesię
kilkatysięcylocidlaminisatelitów.Występująonewobrę-
biegenówtakichjak:geninsuliny,kolagenutypuII,mie-
liny,apolipoproteiny,0-globinyorazwspecyficznychloci
zlokalizowanychpozagenamistruktury.Niektóresekwen-
cjepowtórzoneulegajątranskrypcji,niemajednakdowodu
naichekspresję.WyjątkiemjestnadzmiennylocusMUC1,
którykodujewysocepolimorficznąmucynę.Biologiczna
funkcjaminisatelitarnegoDNAniejestznana.Jednazhipo-
tezmówi,żezewzględunapołożeniesekwencjetemogą
miećznaczeniewtworzeniuparchromosomówhomolo-
gicznychirekombinacji.Sekwencjompowtórzonymprzy-
pisujesięrównieżwpływnastrukturęchromosomów,
trwałośćtranskryptóworazudziałwregulacjiekspresji
genów.Spośródsekwencjiminisatelitarnychrekrutująsię
tzw.sondyJefreya,wykorzystywanekilkanaścielattemu
wbadaniupokrewieństwaczłonkówdanejrodziny.
Mikrosatelitytosekwencjetandemowe,wktórychpod-
stawowymotywzawieraod1do6nukleotydówipowta-
rzasięwpojedynczymlocusod5do100razy.Mikrosatelity
rozłożonerównomiernieco6-10kpz,równieżwobsza-
rachzajmowanychprzezgeny.Pięćgruppowtórzeńmono-,
di-,tri-ipentanukleotydowych(A>AC>AAAN>AAN
>AG,gdzieNoznaczaC,G,T)występujenajczęściejista-
nowi76%znanychsekwencjimikrosatelitarnych.Wgenach
zwykleumiejscowionewsekwencjachflankujących
iintronach,chociażspotykanerównieżwsekwencjach
kodujących.Badaniapopulacyjnewykazują,żesekwencje
mikrosatelitarnecharakteryzująsięmałączęstościąmutacji,
itozarównowkomórkachrozrodczych,jakisomatycznych.
Najmniejmożnaobecniepowiedziećotejczęścigenomu,
którąokreślonojakoninną”
,mimoże,jaksięwydaje,towłaś-
nietamzakodowanajestwiększośćinformacjiregulacyjnych,
decydującychorozwojuifunkcjonowaniuorganizmu.
2.2.3.Kariotyp
Prawidłowakomórkasomatycznaczłowiekajestdiploidalna
izawiera23parychromosomów.Jedenchromosomzkażdej
parypochodziodmatki,drugiodojca.Zestawchromoso-
mówkomórkizostałpodzielonynasiedemłatwychdoodróż-
nieniagrup,oznaczonychpoczątkowymiliteramialfabetu
odAdoG.Wkażdejgrupiechromosomymająpodobną
wielkośćikształtorazuszeregowanemalejąco(ryc.2.7).