Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
B2.Identyfikacjabakterii
11
analizafosfolipidowychkwasówtłuszczowych(PLFA,ang.phospholipidlinkedfatty
acidanalysis)ocharakterzebardziejspecyficznymicechującasięwiększączułością.
JakożełatwiejszeitańszestajesięsekwencjonowanieDNA,obecniestandardowąmetodą
uzupełniającąwynikianalizbiochemicznychifizjologicznychjestsekwencjonowanie
genu16SrRNA(rozdziałB3).Choćpodejścietojeszczebardziejrozmywagranicemiędzy
identyfikacjąafilogenezą,wynikimożnapozyskaćłatwoiniskimkosztem;uwzględ-
nianiewyłączniedanychsekwencyjnychmożejednakwprowadzaćbadaczawbłąd.
Identyfikacjapatogenów
Dopewnegostopnia,akonkretniejeśliidzieoidentyfikacjęorganizmówchorobo-
twórczych,mikrobiologiamedycznaznajdujesięwogoniemikrobiologiijakonauki.
Zuwaginakosztywciążprzeprowadzasięturutynowąidentyfikacjępatogenówna
podstawieklasycznychmetodbakteriologicznych.Sprowadzasiętozazwyczajdo:
izolacjilubwzbogaceniabakteriizpreparatuklinicznegozapomocąbulionulubagaru,
przygotowaniaczystejkulturyzhodowlipierwotnejuzyskanej,identyfikacjibakterii
podmikroskopem,opisaniacharakterystykijejwzrostuiczasemtakżeprzeprowa-
dzeniaPCR.Zuwaginato,żemetodatabazujenahodowlipatogenów,wieleznich
umykałouwadzenaukowców.Dlaprzykładuprzezlataniewiedziano,żenajczęstszym
patogenemwywołującymzatruciepokarmowesąbakteriezrodzajuCampylobacter,
ponieważbyłykłopotyzichhodowaniemwlaboratorium.Niektórebakteriesążywe,
leczniedającesięhodować(VNBC,ang.viablebutnon-culturable),cooznacza,że
możnajestwykryć,aleniemożnawyhodowaćichwlaboratorium).Wmikrobiologii
środowiskowejtenterminfunkcjonujejużoddawna.Jeślimikrobiologiamedyczna
przyjmiedowiadomościichistnienie,towzrośniepoprawnośćdiagnoz,jakożekoszty
PCRstopniowospadają.
Identyfikacjainazewnictwopatogenówopierasięraczejnaobjawachzgłaszanych
przezpacjentaaniżelinaogólnychwłaściwościachsamegomikroorganizmu.Dlaprzy
-
kładurodzajebakteriijelitowychsąbardzobliskospokrewnionenapoziomiegene-
tycznym,alewywołująwieleróżnychchoróbuczłowieka(tab.1).Dziękianalizom
Tabi1iChorobywywoływaneprzezbakteriejelitowezaliczanedoróżnychrodzajów
Rodzaj
Escherichia
Shigella
Salmonella
Vibrio
Klebsiella
Yersinia
Choroba
Biegunkawywołanaprzezpałeczkęokrężnicy
Czerwonka
Durbrzuszny,zakażenieprzewodu
pokarmowego
Cholera,zakażenieprzewodupokarmowego
Zapaleniepłuc
Dżuma
