Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
B–SYSTEMATYKA
B2.Identyfikacjabakterii
Podstawowepojęcia
Identyfikacja
bakterii
Identyfikacja
napodstawie
charakterystyki
wzrostu
Innemetody
identyfikacji
Identyfikacja
patogenów
Zagadnienia
powiązane
Doniedawnawwarunkachlaboratoryjnychizolat
identyfikowanonapodstawieprzeprowadzanych
przezniegoprocesówbiochemicznych.Obecniecoraz
częściejpierwszymkryteriumwykorzystywanymprzy
opisywaniunowegoizolatusądaneuzyskanewwyniku
sekwencjonowania,acechyfizjologiczneibiochemiczne
bierzesiępoduwagęjakododatkowepotwierdzenie
klasyfikacjilubniebierzesięichpoduwagęwogóle.
Widentyfikacjiizolatówmożnabraćpoduwagęichwzrost
naokreślonychpodłożach,któremogąbyćselektywne
iróżnicujące(diagnostyczne).Określajączdolnośćdanego
organizmudorozkładukonkretnychcukrówibiorąc
poduwagę,jakimienzymamiorganizmtendysponuje,
opracowujesiętaksonomięnumeryczną.Następnie
możnająwykorzystaćdoidentyfikacjiorganizmu,czyto
korzystajączdostępnychbazdanych,czytozBergey’s
ManualofSystematicsofArchaeaandBacteria.
Mikroorganizmymożnaidentyfikowaćnapodstawie
wytwarzanychprzeznie,wokreślonychwarunkach,
kwasówtłuszczowych(FAME,analizametylowanych
estrówkwasówtłuszczowych)lubanalizującsekwencję
ich16SrRNA.
Wlaboratoriachmedycznychczęściejstosujesię
klasyfikacjębiochemicznąwyizolowanejczystejkultury
niżtechnikimolekularne,którewykorzystywanesąraczej
wbadaniachnieklinicznych.Ponieważjednakmetoda
PCR(reakcjałańcuchowapolimerazy)stajesiętańsza,
corazwięcejlaboratoriówmedycznychwdrażatechniki
molekularne.Identyfikacjabakteriipatogennychopiera
siębardziejnaichwłaściwościachchorobotwórczych
niżnaichfilogenezie,coprowadzidopewnych
nieprawidłowościwklasyfikacjibakterii.
B1.Systematyka
prokariotów
B3.Analizyfilogenetyczne
napodstawiesekwencji
genurRNA
