Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
8
B–SYSTEMATYKA
gatunkuoróżniącychsięniecowłasnościachstosujesiępojęciebiowaru;nabiowary
OrientalisiMediaevalisdzielisięnaprzykładwywołującądżumębakterięYersinia
pestis.Różniącesięszczepytegosamegogatunkudzielisięczasemnapodgatunki,
naprzykładpatogenroślinPectobacteriumcarotovorumzawieradwapodgatunki:
atrosepticaicarotovorum.Wtymprzypadkupodgatunekobejmujeprzedstawicieli
gatunkuwywołującychokreślonechorobyroślin.Wbadaniachmikrobiologicznych
kłopotzdefinicjągatunkusprawia,żeprzyopisywaniudanegoorganizmunajlepiej
jestzachowaćpierwotnykodizolatu,dziękiczemumożliwebędzieodtworzeniejego
historiiwróżnychlaboratoriach.
Choćwśródmikrobiologówpanujezgodacodoklasyfikowaniaposzczególnych
bakteriiiarcheonówdopoziomurodzaju,wciążnarozstrzygnięcieczekakwestia
definicjipodstawowejjednostkiróżnorodnościgenetycznej,mianowiciegatunku.
Definicjagatunkunależącegodookreślonegorodzaju(np.napodstawiehomologii
DNAwprocencieniemniejszymodwyznaczonegoprogu)niekonieczniesprawdza
sięwodniesieniudogatunkunależącegoodinnegorodzaju,costanowiszczególny
problemwprzypadkutaksonówzdominowanychprzezpatogenyczłowieka(rozdział
B2).Jeślizaśniejesteśmywstaniewprawidłowyispójnysposóbzdefiniowaćgatunku,
problematycznastajesięproceduraidentyfikacjiorganizmudotegowłaśniepoziomu.
Metodyidentyfikacjiprokariotów,czylisposobyklasyfikowanianowychizolatów,
omawianesąszerzejwrozdzialeB2.
Filogenezaprokariotów
Filogenezatoopiszależnościewolucyjnychwobrębietaksonówimiędzynimi.
Badaniamikrobiologiczne(inaczejniżprzypadkubadańnadroślinamiczyzwierzę-
tami)zamiastnamorfologiiopierająsięwogromnymstopniunasekwencjachDNA
stanowiącychźródłodanychfilogenetycznych;naukatatofilogenetyka.Klasyfikacja
bakteriiiarcheonówwprzeważającymstopniuodzwierciedlaichfilogenezę,aprzy-
najmniejnasząobecnąwiedzęfilogenetyczną.Zawszeistniejeoczywiścieprzestrzeń
dodebatnaddanymsystememklasyfikacji;uczeniwciążdyskutująnatematprawidło-
wościstatusufilogenetycznegoitaksonomicznegowielugatunkówirodzajów.
