Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
Kiedywykonaćcelowanebadaniegenetyczne?
Kiedywykonaćcelowanebadaniegenetyczne?
13
Szereguchoróbnerwowo-mięśniowychniedasięzdiagnozowaćprzypomocy
technikiNGS.Dziejesiętakprzedewszystkimzewzględunatypdefektumole-
kularnegowiązanegozdanąjednostkąchorobową,któregonaobecnympoziomie
rozwojutechnologicznegoNGSnniewidzi”.Dotegotypudefektównależąmu-
tacjedynamiczneorazdużedelecje/duplikacje(uzyskaniewynikustajesięcoraz
bardziejmożliwe;zależyjednakodstosowanejmetodyuzyskaniadanychNGS).
Dużymproblememinterpretacyjnymjesttakżeobecnośćwnaszymmaterialege-
netycznymbardzopodobnychdosiebiegenów/regionówgenomu(tzw.pseudo-
genów),nierozróżnianychwysokoprzepustowymitechnikamisekwencjonowania.
Wtakimprzypadkuniewiemy,czyzidentyfikowanywbadaniudefektdotyczy
genuwłaściwego,czyjegobliźniaczopodobnegoodpowiednika,któregouszko-
dzenieniepowodujejednakchoroby.
Dlategowprzypadkukilkuważnychiczęstychschorzeńnerwowo-mięśnio-
wychmusimywybraćcelowanebadaniegenetyczneukierunkowanenakonkret-
nydefektmolekularny.Należądonich:
1.DystrofiamięśniowaDuchenne’a(Duchennemusculardystrophy,DMD)
DystrofiamięśniowaDuchenne’a,jakiinnedystrofinopatie,wiązanajest
zuszkodzeniemgenuDMD.Około70%identyfikowanychwariantówgenu
DMDstanowiądelecjeiduplikacje.Dowykryciaww.defektówwskazane
jestbadaniemetodąMLPA(multiplexligation-dependentprobeamplifca-
tion)jakopierwszebadaniediagnostyczne.Dopierobrakdelecji/duplikacji
wgenieDMDjestwskazaniemdosekwencjonowaniagenu.
2.Rdzeniowyzanikmięśni(spinalmuscularatrophy,SMA)
Uokoło96%pacjentówzSMAidentyfikujesięobuallelicznąutratę(brak
obukopii)genuSMN1.Dowykryciaww.defektuwskazanejestbadanie
metodąMLPAlubRT-PCR(real-timepolymerasechainreaction,reakcjałań-
cuchowapolimerazywczasierzeczywistym).Wrazzwprowadzeniemdopro-
gramubadańprzesiewowychnoworodkówanalizywkierunkuSMAkażdy
noworodekmawykluczonąobuallelicznądelecjęgenuSMN1.Badaniaprze-
siewowewkierunkuSMAnieidentyfikują2-3%dziecizrzadkimimutacjami
punktowymigenuSMN1.WprzypadkuobjawówsugerującychSMAnadal
metodądiagnostycznązwyborujestbadaniemetodąMLPA,awprzypadku
potwierdzeniaobecnościjednejkopiiSMN1sekwencjonowaniegenuSMN1
wkierunkumutacjipunktowych.
3.Dystrofiamiotonicznatypu1itypu2(myotonicdystrophy1and2,DM1
iDM2)
Obiechorobyzwiązanesązmutacjamidynamicznymi,czylizwielokrotnie-
niem(ekspansją)liczbysekwencjipowtórzonych(DM1-ekspansjapowtó-
rzeńCTGwgenieDMPK,DM2-ekspansjapowtórzeńCTTGwgenie
