Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
technikianalizykwasównukleinowychwkontekściediagnostykimolekularnej…
Sekwencjonowanienastępnejgeneracjisprawdzasięznakomiciejakonarzę-
dziedowykrywaniawariantówpunktowych(włączającwtodelecjeiinsercje
ozakresieodjednegonukleotydudokilkudziesięciunukleotydów).Niecowię-
cejtrudnościnastręczaanalizazmiennościliczbykopii(copynumbervariation,
CNV),wtymprzypadkuopierającasięnaanaliziepokryciadanegoobszaru
względempokryciainnychobszarów(obszardelecjicharakteryzujesiępokry-
ciemniższymniżprzeciętne,obszarduplikacji-wyższym).AnalizaCNVniema
większegoznaczeniawkontekściechoróbmitochondrialnych.Większedelecje
znajdowanowniewielugenachpowiązanychztągrupąchorób-sąstosunkowo
częstewgenieOPA1,opisywanojetakże,choćwjednostkowychprzypadkach,
wgeniePOLG.
41
Proponowanealgorytmydiagnostykimolekularnej
wprzypadkuwybranychchoróbmitochondrialnych
Stworzeniejednego,spójnegoalgorytmudlawszystkichchoróbmitochondrial-
nychwydajesięniemożliwe.Natomiastdecyzjeoprzeprowadzeniubadańge-
netycznych,ichzakresieiwykorzystywanymmaterialebiologicznychpodejmuje
sięnapodstawiewieluzmiennych:objawówklinicznych,wynikówbadańlabora-
toryjnych,histologicznychiobrazowych,biorącjednocześniepoduwagędostęp
dobadańgenetycznychimożliwościichfinansowania.Poniżejznajdujesiękilka
propozycjipostępowaniawprzypadkukonkretnychchoróbmitochondrialnych.
dziedzicznaneuropatiawzrokowaLebera-wpierwszymrzędzienależy
sprawdzićobecnośćczęstychpatogennychwariantówmtDNAprowadzącychdo
choroby(m.11778G>A,m.3460G>A,m.14484T>C),ewentualnierozszerza-
jącanalizęowszystkiegenymitochondrialnekodującepodjednostkikomplek-
suI(jeślistosowanejestNGS,możnazsekwencjonowaćcałymtDNA).Wyda-
jesię,żewprzypadkunegatywnychwynikówkolejnymkrokiempowinnobyć
sekwencjonowaniegenuDNAJC30.
ZespółMELAS-wpierwszejkolejnościnależysprawdzićobecnośćwarian-
tumtDNAm.3243A>G;następnieprzeprowadzićbadaniewkierunkurozległej
delecjiizsekwencjonowaćcałymtDNA.
ZespółMERRF(padaczkamioklonicznazwłóknamiszmatowatymi,
myoclonicepilepsywithraggedredfbers)-wpierwszejkolejnościnależyspraw-
dzićobecnośćwariantumtDNAm.8344A>G;następnieprzeprowadzićbadanie
wkierunkurozległejdelecjiizsekwencjonowaćcałymtDNA.
ZespółKaernsa-Sayre’a,ZespółPearsona-należyprzeprowadzićbadanie
wkierunkurozległejdelecjimtDNA.
ZespółLeigha-wpierwszejkolejnościnależyprzeprowadzićanalizęgenów
SURF1iSCO2.Wprzypadkuuzyskanianegatywnychwynikówlubwprzypadku
