Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
GENETYKAZACHOWANIAWPSYCHOLOGIIIPSYCHIATRII
złożonymmechanizmomtransmisjigenetycznej.Prostymprzykłademnie-
mendlowskiejtransmisjijestheterogennośćgenetyczna,kiedyokreślona
choroba(cecha)wniektórychrodzinachspowodowanajestprzezmutację
umiejscowionąwlocusA,natomiastwinnychrodzinachprzezmutację
umiejscowionąwlocusB.DlatakichprzypadkówSmith(1959)zapro-
ponowałsposóbanalizyzwanymodelem„domieszki”(admixturemodel),
wktórymtylkopewnaproporcja(α)rodzinwykazujesprzężeniemiędzy
locuschorobyamarkerem.Hipotezaobrakusprzężenia(H1)odnosisię
wtymmodeludosytuacji,wktórejΘ=0,5lubα=0;hipotezamówiąca
ohomogenicznymsprzężeniu(H2)odnosisiędowarunków,wktórych
Θ<0,5iα=1;hipotezaoistnieniuheterogenności(H3)zaś–dowarun-
ków,wktórychΘ<0,5iα>0,5.StosunekprawdopodobieństwaH3do
prawdopodobieństwaH2testujeheterogenność.Sprzężenieprzyzałożeniu
heterogennościtestowanejestprzezstosunekprawdopodobieństwH3iH1.
Inneprzypadkizłożonejtransmisjiodnosząsiędosytuacjiistnienianiskiej
penetracjilubbrakuokreślonegofenotypuuosóbzgenotypemwysokiego
ryzyka(lubteżsytuacjiodwrotnej–obecnościfenotypuoosóbzgenoty-
pemniskiegoryzyka–tzw.fenokopie).Ogólnymodelpojedynczegolocus
(generalizedsinglelocusmodel)stosowanywtakichprzypadkachdotesto-
waniasprzężeniaumożliwiazałożeniearbitralnychparametrówpenetracji
dlakażdegogenotypu(por.ShamiMcGuffin2002).
Parametrycznaanalizasprzężeńpodlegatymsamymograniczeniom,
cokażdainnametodaopartanazałożonymzgórymodelu.Możezatem
charakteryzowaćsiędużąmocąwprzypadkuuwzględnieniapoprawnych
założeń.Użyciezaśzłegomodelumożeprowadzićdouzyskaniafałszywego
sprzężeniai/lubpominięciaprawdziwegosprzężenia.Wreszcie,testowanie
wielumodeliwymagaprzyjęciawysokiegopoziomuistotności,comoże
obniżyćmocpotrzebnądowykryciaposzukiwanegogenu(LanderiSchork
1994).
Choćmetodanieparametryczna–takjakopisanapowyżejparametryczna
analizasprzężeń–opierasięnapodobnejkoncepcjisprzężenia,stosowanie
tejostatniejniewymagaprzyjęciazgóryokreślonegomodeludziedziczenia
badanejcechylubchoroby.Nieparametrycznaanalizasprzężeńbadadzie-
leniealleli(allelesharing)uparkrewnych(zwyklerodzeństwa)wwielu
różnychrodzinach.Techniczniedzielenieallelidefiniowanejestjako„iden-
tycznośćpoprzezstan”(identity-by-state–IBS)lub„identycznośćpoprzez
pochodzenie”(identity-by-descent–IBD).Dwaallelemająceidentyczną
postać(np.mającetęsamąsekwencjęDNA)określanesąjakoidentyczne
poprzezstan.Allelepochodząceodtegosamegoalleluobecnegouwspól-
20
negoprzodkaokreślanesąnatomiastjakoidentycznepoprzezpochodzenie.
