Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
GENETYKAZACHOWANIACZŁOWIEKA:OGÓLNEZAŁOŻENIAIMETODYBADAWCZE
PierwotniezarównoIBS,jakiIBDużywanoprzydefiniowaniudzieleniaal-
leli.ObecniepowszechnieprzyjmujesiędefinicjęIBDjakomającąwiększą
wartośćinformacyjnąimniejzależnąodprawidłowegookreśleniaczęstości
allelimarkera(ShamiMcGuffin2002).Najczęściejstosowanąmetodą
nieparametrycznejanalizysprzężeńjestschematsprzężeniadotkniętych
zaburzeniemparrodzeństwa(affectedsibpairs–ASP).Przyjegowyko-
rzystaniuanalizujesięczęstośćdziedziczeniaprzezobojerodzeństwatych
samychgenówmarkerowychIBD.Hipotezazerowaobrakusprzężenia
mówi,żerodzeństwodzieliśredniopołowęgenówIBD.Jeżelidzielenie
IBDmożebyćjednoznaczniewyznaczonezgenotypówmarkerowych,to
analizasprowadzasiędotestowania,czyproporcjaalleliIBDpomiędzy
paramirodzeństwajestwiększaniż50%.Wbardziejprawdopodobnym
przypadku–niemożliwościjednoznacznegowyznaczeniadzieleniaIBD
–danesąanalizowaneprzywykorzystaniumetodyszacowaniaprawdo-
podobieństwa,któratraktujeproporcjęalleliIBDjakonieznanyparametr.
Wwynikutejanalizyuzyskiwanajesttzw.maksymalnawartośćLOD(ma-
ximumlodscore–MLS),podsumowującadowodynaistnieniesprzężenia
(Holmans1993).Możliwośćwykryciaprzypuszczalnegolocuschoroby
przyużyciumetodyASPzależnajestodwkładu,jakitenżelocuswnosido
podobieństwarodzinnego.Wkładtenmierzonyjestzwyklewkategoriach
zwiększonegoryzykapojawieniasiędanejchorobyukrewnychdotkniętej
niąjednostkiwporównaniuzrozpowszechnieniemjejwpopulacjiogólnej
(np.zapomocąwspółczynnikaryzykarodzeństwa–λs–definiowanego
jakopoziomryzykarodzeństwaosobydotkniętejdorozpowszechnienia
chorobywpopulacji)(Risch1990).Metodędzieleniaallelimożnatakże
zastosowaćprzyposzukiwaniugenówzwiązanychzcechamiocharakte-
rzeilościowym.HasemaniElston(1972)zaproponowalimetodęanalizy
dzieleniaallelidlacechilościowych,opartąnazałożeniu,żepodobieństwo
fenotypowepomiędzydwomakrewnymijestskorelowanezliczbądzie-
lonychprzeznichalleliumiejscowionychwlocuszwiązanymzbadaną
cechą.Technicznietametodaanalizysprowadzasiędowykonaniaregresji
kwadraturóżnicmiędzywartościamicechyukrewnychwzględemproporcji
alleliIBD.
LanderiKruglyak(1995)sformułowaliwskazówkiodnośniedoin-
terpretowaniawynikówanalizysprzężeńwprzypadkucechzachowania
ozłożonymsposobiedziedziczenia.WartośćLODwiększaod3,3dladu-
żychrodzini3,6dlaparrodzeństwaświadczywedługautorówoistotnym
sprzężeniu.Odpowiednio,wartościwiększeod1,9i2,2sugerują,żemamy
doczynieniazesprzężeniem.
21
