Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
42
3.BadaniaGenetyCznewCHoRoBaCHmitoCHondRiaLnyCH
dowodównaodmatczynedziedziczeniechorobytrzebasprawdzićobecność
któregośzwariantówwmitochondrialnymgenieMT-ATP6m.8993T>G,
m.8993T>C,anastępniezsekwencjonowaćcałymtDNA.Jeśliwynikisąnega-
tywne,rozważyćanalizępanelugenówzzastosowaniemNGS.
ZespółAlpersa-Huttenlochera,spektrumataksja–neuropatia-należy
przeprowadzićsekwencjonowaniegenuPOLG.
PostępującazewnętrznaoftalmoplegialubzespółPEO+-należyprze-
prowadzićtestwkierunkuobecnościlicznychrozległychdelecjimtDNA,jeśli
wynikjestpozytywny,zsekwencjonowaćgenPOLG,jeśliwywiadrodzinnynie
wykluczadziedziczeniaautosomalnegodominującego,trzebaprzeprowadzićse-
kwencjonowaniegenówTWNKiSLC25A4.Jeżeliwynikisąnegatywne,awe-
ryfikacjaobrazuklinicznegopodtrzymujepodejrzeniechorobymitochondrialnej,
rozważyćanalizępanelugenówzzastosowaniemNGS.
Podejrzeniezespołudeplecyjnego-możnaoznaczyćpoziommtDNA
wtkanceobjętejobjawami,anastępniekorelowaćobjawypacjentazdysfunk-
cjąkonkretnegogenu.Wydajesięjednak,żezewzględuzarównonakoszty,
jakiczas,lepiejjestodrazuprzeprowadzićsekwencjonowaniepanelugenów
zzastosowaniemNGS.
Wprzypadku,gdychorobanieprzyjmujedobrzezdefiniowanejformy,zwy-
klenapoczątkusprawdzasięobecnośćnajczęstszychpatogennychwariantów
punktowychirozległychdelecjiwmtDNA,ewentualniesekwencjonujecały
mtDNA.Jeśliwynikisąnegatywne,klinicznadiagnozachorobymitochondrialnej
zostajeutrzymanainiepojawiłysięnoweprzesłankimogącenakierowaćbadania
nakonkretnygen,należyrozważyćanalizępanelugenówzzastosowaniemNGS.
Nowepotencjalniepatogennewariantygenetyczne
Stosowaniemetodsekwencjonowaniawysokoprzepustowego,opróczznacznego
przyspieszeniaodkrywaniagenówpowiązanychzchorobamigenetycznymiczło-
wiekaiprzyspieszeniadiagnostyki,spowodowałokoniecznośćanalizymilionów
wariantówwkażdejpróbieipodejmowaniadecyzjioichznaczeniuklinicznym.
ZgodniezzaleceniamiEuroGentestiEuropeanSocietyofHumanGeneticswa-
riantyklasyfikujesięjakołagodne,potencjalniełagodne,onieznanej/niepewnej
patogenności,potencjalniepatogennelubpatogenne.Jakopodstawędookreś-
leniapatogennościwykorzystujesięinformacjeopopulacyjnejczęstościdane-
gowariantu,jegopotencjalnymwpływienaaktywnośćkodowanegoproduktu
(zwyklenapodstawiebioinformatycznejpredykcjipatogenności),danychlite-
raturowychozwiązkudanegogenuiwariantuzchorobączyteżwynikówbadań
funkcjonalnych.Największątrudnośćsprawiajątewarianty,któreostateczniesą
klasyfikowanejakowariantyonieznanejpatogenności,cozwykleoznaczabrak
