Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
34
Rys.1.5.Numeracjaatomówwpierścieniachprolinyitryptofanu
1.Aminokwasy
AtomyazotugrupyguaninowejwargininieoznaczanesąodpowiednioNd,NwiNw´,
przyczymnależypamiętać,żeatomyazotuwiw´sązewzględunamezomerięrówno-
cenne.
Atomywpierścieniuproliny,tryptofanuihistydynysąnumerowanezgodniezzasa-
damiobowiązującymiwchemiizwiązkówheterocyklicznych,tzn.numeracjęzaczynasię
odatomuazotu(rys.1.5).
Częstospotykasięnazwyaminokwasówpoprzedzoneprzedrostkamihomolubnor.
Przedrostekhomooznaczahomologaminokwasu,czylizwiązekzawierającyjedenfragment
CH2więcejniżznanyaminokwasbiałkowy,np.powszechnieużywananazwahomoseryna–
HOCH2CH2CH(NH2)COOHoznaczakwas2-amino-4-hydroksybutanowy,ahomocysteina–
HSCH2CH2CH(NH2)COOH–kwas2-amino-4-sulfanylobutanowy.Natomiastprzedros-
teknoroznaczahomologaminokwasunaturalnegozawierającyjednągrupęmetylenową
–CH2mniej.Stosowanebyłyrównieżtakienazwy,jaknorwalinainorleucyna,którewod-
różnieniuodwalinyileucyny–aminokwasówbiałkowychzawierającychłańcuchyrozgałę-
zione–miałyłańcuchyboczneproste,np.norwalina(obecniezalecanąnazwąjestkwas
2-aminopentanowy)–CH3CH2CH2CH(NH2)COOH(porównajzwaliną)inorleucyna(obec-
niezalecanąnazwąjestkwas2-aminoheksanowy)–CH3(CH2)3CH(NH2)COOH.Zuwagina
nieprecyzyjnośćznaczeniaprzedrostkanorjegostosowanieniejestzalecane.
1.3.Właściwościaminokwasów
1.3.1.Właściwościkwasowo-zasadowe
Zasadowegrupyaminoweaminokwasówoddziałujązgrupamikarboksylowymiwobrę-
bietejsamejcząsteczki,tworzącsólwewnętrzną,czylitzw.jonobojnaczy,znanyrównież
podnazwązwitterionu(rys.1.6).
Chociażobieformyaminokwasu–zjonizowanainiezjonizowana–sąwrównowa-
dze,towwodnychroztworachaminokwasówobojętnych,przypHzbliżonymdo7(roz-
twórobojętny),stężenieformyjonowej(jonuobojnaczego)przewyższaokilkarzędów
stężenieformyniezjonizowanej.Ostopniuikierunkudysocjacjiaminokwasówwroz-
Rys.1.l.Równowagakwasowo-zasadowaaminokwasów
