Chemia obliczeniowa w laboratorium organicznym

Anna Kaczmarek-Kędziera, Marta Ziegler-Borowska, Dariusz Kędziera

Uzyskaj dostęp

Zakup książkę

ISBN/ISSN:

978-83-231-3114-4

DOI:

Wydawnictwo:

Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Mikołaja Kopernika

Rok wydania:

2014

Liczba stron:

440

XML:ISBN/ISSN:

ONIX MARC21

Bibliografia:

. Chemia obliczeniowa w laboratorium organicznym. Red. Kaczmarek-Kędziera, Anna; Ziegler-Borowska, Marta; Kędziera, Dariusz . Toruń: Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Mikołaja Kopernika, 2014, 440 s. ISBN 978-83-231-3114-4

Bibliografia refWorks:

RT Book, Whole

SR Electronic(1)

A2 Kaczmarek-Kędziera, A.

A2 Ziegler-Borowska, M.

A2 Kędziera, D.

T1 Chemia obliczeniowa w laboratorium organicznym

PB Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Mikołaja Kopernika

PP Toruń

YR 2014

SN 978-83-231-3114-4

Bibliografia BibTex:

@Book{ 102289, author = "", editor = "Kaczmarek-Kędziera, Anna and Ziegler-Borowska, Marta and Kędziera, Dariusz", title = "Chemia obliczeniowa w laboratorium organicznym", publisher = "Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Mikołaja Kopernika", year = "2014", address = "Toruń", isbn = "978-83-231-3114-4" }

Bibliografia endNote:

TY - BOOK

AU -

ED - Kaczmarek-Kędziera, Anna

ED - Ziegler-Borowska, Marta

ED - Kędziera, Dariusz

TI - Chemia obliczeniowa w laboratorium organicznym

PB - Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Mikołaja Kopernika

CY - Toruń

PY - 2014

SN - 978-83-231-3114-4

ER -

Netografia (standard APA):

. Red. Kaczmarek-Kędziera, Anna; Ziegler-Borowska, Marta; Kędziera, Dariusz. Chemia obliczeniowa w laboratorium organicznym [baza danych online] Toruń: Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Mikołaja Kopernika, 2014 [dostęp: 16 08 2024]. Dostęp w Ibuk Libra: https://libra.ibuk.pl/reader/chemia-obliczeniowa-w-laboratorium-organicznym-anna-kaczmarek-kedziera-marta-102289.

Autorzy są absolwentami i pracownikami Wydziału Chemii UMK. Specjalizują się w różnych dziedzinach chemii: obliczeniowej (AKK), organicznej (MZB) i kwantowej (DK). Pracując w zespołach interdyscyplinarnych, nabrali przekonania o konieczności popul...

Więcej

ISBN/ISSN:

978-83-231-3114-4

DOI:

Wydawnictwo:

Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Mikołaja Kopernika

Rok wydania:

2014

Liczba stron:

440

XML:ISBN/ISSN:

ONIX MARC21

Wprowadzenie /9
Przedmowa /11
1. Elementy chemii kwantowej /17
1.1. Energia układu /19
1.2. Powierzchnia energii potencjalnej /24
1.3. Warsztat z narzędziami /27
1.3.1. Metoda wariacyjna /28
1.3.2. Szeregi funkcyjne /29
1.3.3. Rachunek zaburzeń /31
1.4. Przybliżenie jednoelektronowe /32
1.5. Bazy funkcyjne/38
1.6. Metody chemii kwantowej /43
1.6.1. Sposoby uwzględniania korelacji elektronowej /45
1.6.2. Teoria funkcjonałów gęstości/47
2. Opis układów π-elektronowych /51
2.1. Przybliżenie π-elektronowe /51
2.2. Metoda H¨uckla /52
2.2.1. Cząsteczka etylenu /54
2.2.2. Annuleny /61
2.2.3. Widmo absorpcyjne /62
2.2.4. Rozkład ładunku π-elektronowegoRząd wiązania π /65
3. Struktura pojedynczej cząsteczki /71
3.1. Wstęp /71
3.2. Wspołrzędne kartezjańskie i wewnętrzne /74
3.3. Gaussian09 - struktura inputu /81
3.4. Gaussian09 - energia układu /83
3.5. Gaussian09 - optymalizacja geometrii /115
3.5.1. Aldehyd octowy/116
3.5.2. (1S)-(–)-α-Pinen/131
3.6. Gaussian09 - analiza drgań harmonicznych /140
3.6.1. Aldehyd octowy /142
3.7. Gaussian09 - stan przejściowy /157
3.7.1. Amoniak /158
3.7.2. Aldehyd 3-aminoakrylowy /164
3.8. Gaussian09 - analiza powierzchni energii potencjalnej /167
3.8.1. Glicyna /167
3.9. Gaussian09 - skan powierzchni energii potencjalnej /173
3.9.1. Oddziaływanie benzenu z kationem sodu /173
3.9.2. 1,2-Dichloroetan /177
3.10. Gaussian09 - ścieżki reakcji /184
4. Właściwości spektroskopowe cząsteczek /193
4.1. Gaussian09 - widmo UV /193
4.1.1. Etylen /195
4.1.2. Izopren /202
4.1.3. Metyloheksahydronaftalenon /208
4.2. Gaussian09 - widmo NMR /211
4.2.1. 2-Buten - przesunięcie chemiczne w 1H NMR /214
4.3. Gaussian09 - skręcalność właściwa /223
4.3.1. Kwas (S)-(−)-parakonowy /228
5 Cząsteczka w otoczeniu chemicznym /237
5.1. Słabe oddziaływania międzymolekularne /237
5.1.1. Gaussian09 - energia oddziaływania międzymolekularnego /243
5.1.2. Gaussian09 - zautomatyzowany sposób liczenia oddziaływań /251
5.1.3. Gaussian09 - skan oddziaływania po odległości /254
5.2. Gaussian09 - modelowanie efektów rozpuszczalnikowych /259
5.2.1. Optymalizacja geometrii w rozpuszczalniku /262
5.2.2. Swobodna entalpia solwatacji /266
5.2.3. Wpływ efektów rozpuszczalnikowych na stan równowagi chemicznej /269
5.2.4. Wpływ efektów rozpuszczalnikowych na wysokość barier rotacji /272
5.2.5. Widmo IR w fazie skondensowanej /273
5.2.6. Przesunięcie solwatochromowe /279
5.2.7. Wpływ rozpuszczalnika na położenie sygnałów NMR /282
5.2.8. Wpływ rozpuszczalnika na skręcalność /283
6. Chemia obliczeniowa w pracy eksperymentalnej /287
6.1. Lipofilowość /287
6.1.1. Zasady kwasów nukleinowych /289
6.2. Kwasowość/zasadowość /292
6.2.1. Deprotonowanie pirolu /292
6.2.2. Stała proteolizy /300
6.2.3. Potencjał redox /302
6.3. Reaktywność produktów pośrednich /303
6.4. Reaktywność układów aromatycznych /305
6.4.1. Aromatyczność układów organicznych /305
6.4.2. Substytucja elektrofilowa w pierścieniu aromatycznym /314
6.4.3. Substytucja elektrofilowa w układach heterocyklicznych /317
6.5. Opis układow otwartopowłokowych /318
6.5.1. Kation, rodnik i anion allilowy /321
6.6. Reakcje pericykliczne /327
6.6.1. Reakcje cykloaddycji /328
6.6.2. Reakcje elektrocyklizacji /339
7. Zadania i ćwiczenia /345
A Linux: Rzecz o wolności /361
A.1. Logowanie /361
A.2. Komunikacja pomiędzy maszynami /362
A.2.1. ssh, scp /362
A.2.2. Window(s) na świat: PuTTy, WinSCP /364
A.3. Podstawowe komendy /364
A.4. Edytor tekstu /367
A.5. Inne przydatne narzędzia /370
B Rozwiązania zadań /375
Bibliografia /413
Indeks rzeczowy /433
Ilustracje /439

Przedmowa

ułatwićżycieeksperymentatora.Jednakniezawszeoczywistejest,

gdzieszukaćkontaktu.Najprostszerozwiązania—rozejrzeniesiędo-

okołaiposzukaniewokółsiebiekogoś,ktoposługujesięsprawnie

narzędziamichemiiobliczeniowej—niezawszepierwszeprzychodzą

dogłowy.Ponadtopojawiająsięwątpliwościdotyczącekomunikacji

iobawprzedewentualnąrozmowązewzględunawynoszonąjeszcze

zeszkoły,apotemkultywowanąnastudiachtakżenakierunkachche-

micznychifarmaceutycznychniechęćdomatematykiinarzędzima-

tematycznych.Eksperymentatorpostudiachchemicznych,któryma

zasobąkursmatematykiichemiikwantowejiobydwateegzaminy

częstowspominanieprzyjemnie,niemyśliswobodnieoprzyjaznych

kontaktachzosobami,któremogąodniegowymagaćznówtychsa-

mychskomplikowanychrzeczyimówićdoniegomałozrozumiałym

językiem.Koniecznezatemjestodmitologizowaniemetodchemiiobli-

czeniowejiwypracowaniewspólnegojęzykapomiędzyeksperymenta-

toramiiobliczalnikami.Wymagatowspółpracyobustron:ekspery-

mentatormusiumiećprzedstawićswójproblemwsposóbkonkretny

iumożliwiającyjegoanalizęnumeryczną,natomiastobliczalnik—

dobraćodpowiednienarzędziadobadanegoproblemu.Zatemekspe-

rymentatormusiwykazaćchoćbyminimalnąznajomośćmożliwości

chemiiobliczeniowej,abyumiećwyrazićswojepotrzeby.Uniwersy-

teckiekursychemiikwantowejsąwysocezmatematyzowaneidotyczą

zagadnieńchemiistricteteoretycznej.Jaknaironię,takikurskoń-

czysięzwykletam,gdziezaczynająsiezainteresowaniaorganika—

naukładachdwu-,awnajlepszymprzypadkukilkuatomowych.Nie

ułatwiatowięcżyciaadeptatechnikobliczeniowychpracującegona

codzieńeksperymentalnie,ponieważniewskazujewprostzwiązku

wyprowadzanychpracowicierównańzpożądanymwspółczynnikiem

podziałupomiędzyoktanoliwodęczyinformacjąoskręcalnościwła-

ściwejbadanejcząsteczki2.Zdrugiejstrony,jeżelieksperymentator

2Chociażbezkursuchemiikwantowejtrudnorozumiećbudowęatomuiczą-

steczkiizawiłościichzachowaniawśrodowiskureakcji.

Brak wyników

Chemia obliczeniowa w laboratorium organicznym

Treść książki

Znajdź bibliotekę blisko siebie, i uzyskaj dostęp do ebooka w systemie IBUK Libra