Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
intoaprecisegeometricform,asaline
boksylowych:octowego,propionowego,
ofmelodywrittenincanonformandso
masłowego,walerianowegoikaprono-
designedbyNaturetofoldbackupon
wegoorazdwóchkwasówdikarboksylo-
itself,creatingharmonicchordsofinter-
wych,tj.bursztynowegoiglutarowego
actionconsistentwithbiologicalfunction
(tab.2.3).
(...)”[P74,s.35].(„Uderzyłomnieostat-
Wszystkieaminokwasywystępujące
nio,żewistociesekwencjaaminokwasów
wbiałkachsąto:1)Ø-aminokwasy(do-
wcząsteczcebiałka,układającasięwpre-
kładniej:190-aminokwasówijedenimi-
cyzyjnąformęgeometryczną,jestjak
nokwas—prolina),2)
L
-aminokwasy,
melodiazapisanawformiekanonuitak
3)związkioptycznieczynne,4)związki
pomyślanaprzezprzyrodę,bymogła
amfoteryczne(zawierającegrupynała-
złożyćsięwprzestrzeni,tworząchar-
dowanedodatnioiujemnie)oraz5)związ-
monijneakordyoddziaływańzgodnych
kiamfipatyczne(zawierającegrupyhy-
zfunkcjąbiologiczną.(...)”)[P75,s.48].
drofoboweihydrofilowe).
Cząsteczkabiałkowatotrójwymiarowy
układjednegolubkilkułańcuchówpoli-
2.5.PODSUMOWANIEZUZUPEŁNIENIEM
peptydowych,czyliliniowychinieroz-
gałęzionychpolimerówwielu0-amino-
Spośródokoło180różnychaminokwa-
kwasów,połączonychkowalencyjniewią-
sówistniejącychwprzyrodzie,tylko20
zaniamiamidowymizwanymiumownie
stanowiuniwersalnecegiełkibudulcowe
peptydowymi.Strukturatejprzestrzennej
wszystkichbiałekssaków,tzw.magiczną
konstrukcjijesthierarchicznaizawiera
dwudziestkę.Wszystkieaminokwasypo-
czterygeneralnepoziomyuorganizowa-
zajedynymiminokwasem,proliną,są
nia:I,II,IIIiIVrzędu.
pochodnymipięciukwasówmonokar-
Strukturępierwszorzędowąstanowi
kolejność,czylisekwencjaposzczegól-
Tabela2.3.Nazwysystematycznelubpółsys-
nychaminokwasówwłańcuchupolipep-
tematyczneaminokwasów
tydowymuwarunkowanawiązaniamipep-
Lp.
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Symbole
Gly
Ala
Phe
Tyr
Trp
Thr
Val
Lys
Cys
Met
Arg
Leu
Asp
Asn
Ser
His
Pro
Gln
Glu
Ile
aminooctan
2-aminopropionian
2-amino-3-hydroksypropionian
2-amino-3-tiopropionian
2-amino-3-fenylopropionian
2-amino-3-(4-hydroksyfenylo)-
2-amino-3-indolopropionian
2-amino-3-imidazolopropionian
2-amino-3-metylo-3-etylo-
2-amino-4-metylotiomaślan
2-amino-3-hydroksymaślan
2-amino-izowalerianian
2-amino-5-guanidynowalerianian
2-aminoizokapronian
2,6-diaminokapronian
aminobursztynian
2,4-diaminobursztynian
2-aminoglutaran
2,5-diaminoglutaran
pirolidyno-2-karboksylan
propionian(p-hydroksy-Phe)
propionian
Nazwaaminokwasu
tydowymi(energiawiązania:100kcal,
tj.400kJ/mol).
Strukturadrugorzędowa—tolokal-
neuorganizowaniewprzestrzeni„krę-
gosłupa”peptydowegobezuwzględnie-
niałańcuchówbocznychresztamino-
kwasowych,uwarunkowanaplanarnością
wiązaniapeptydowegoorazlicznymi
wiązaniamiwodorowymi(energiawią-
zania:3–7kcal,tj.12–29kJ/mol).Wy-
odrębniasię:1)strukturęł,tj.harmo-
nijkową,czylipofałdowanejkartki(okres
identyczności:0,65–0,67nm);2)0-he-
liks(okresidentyczności:0,54nm);
3)strukturękolagenu(okresidentycznoś-
ci:0,28–0,29nm)oraz4)zakrętł(zagię-
ciełlubł-skręt),tj.pętlę,wktórejgrupa
karbonylowaaminokwasuwpoz.1two-
rzywiązaniewodorowezgrupąiminową
aminokwasuwpoz.4.
49
