Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
Katalitycznarolaenzymów35
Enzym
..
NH
Pierścień
imidazolowy
N
..
H
Enzym
N
H
NH
..
Enzym
N
H
..
NH
Strukturyrezonansowestabilizująceładunek
RYS.3.8.Histydynadziałającajakosłabazasada
Dodatkowemateriałymożnaznaleźćwartykule
internetowym1:Sterydyjakonoweśrodki
przeciwnowotworowe(Steroidsasnovelanticanceragents)
nastroniewww.oxfordtextbooks.co.uklorclpatrick6el
3.5.3.Grupynukleoflowe
Wmiejscachaktywnychniektórychenzymówwystępują
aminokwasyserynaicysteina.Mająoneresztynukleofilowe
(odpowiednioOHiSH),któremogąuczestniczyćwprze-
biegureakcjienzymatycznej.Odbywasiętopoprzezinter-
akcjęzsubstratem,prowadzącądopowstaniaproduktów
pośrednich,któreniepowstałybypozareakcjąenzymatycz-
ną.Związkipośredniestwarzająalternatywnyszlakreakcji,
któryomijawysokoenergetycznystanprzejściowy,atym
samymdochodzidozwiększeniaszybkośćreakcji.
ZwyklegrupaalkoholowaOH,takajaktaobecnawse-
rynie,niejestdobrymnukleofilem.Jednakabymogłodojść
doreakcji,wcentrumaktywnymznajdujesięonawpobli-
żuresztyhistydyny.Przykłademmożebyćreakcjahydro-
lizywiązaniapeptydowego(rys.3.9)przezchymotrypsynę,
wktórejbierzeudziałtriadakatalitycznaaminokwasów-
seryna,histydynaikwasasparaginowy.Serynaihistydyna
uczestnicząwmechanizmiereakcjiodpowiedniojakokatali-
zatornukleofilowyikwasowo-zasadowy.Resztakwasuaspa-
raginowegowchodziwinterakcjęzpierścieniemhistydyny
powodującaktywacjęodpowiedniegoszlakureakcji.
Obecnośćnukleofilowejresztyserynypowoduje,żena
początkowymetapiereakcjiniesąniezbędnecząsteczki
wody.Jesttoważne,ponieważwodajakosłabynukleofilmoże
miećtrudnościzpenetracjązajętegomiejscaaktywnego.
Podrugie,cząsteczkawodyzanimmogłabywejśćwreakcję,
najpierwmusiałabywsunąćsięwmiejsceaktywneiodnaleźć
grupękarboksylową.Byłobytocośnakształtgrywciuciu-
babkę.Zdrugiejstronyenzymmożedostarczyćserynową
grupęhydroksylową,znajdującąsiędokładniewmiejscu
Ser
Ser
Ser
R
R
R
:
:
:
..
O
C
O
OH
..
O
C
:
:
:
O
O
C
H
:
OH
:
H
NH
:
:
:
N
O
:
N
N
R′
:
His
His
His
H
N
N
N
H
H
H
Asp
H2N–R′
Asp
Asp
O
O
O
O
O
O
Ser
Ser
R
R
:
::
:
..
O
O
C
O
:
:
O:
C
..
..
O
H
H
NH
H
:
:
N
N
R′
His
His
N
N
H
H
Asp
Asp
O
O
O
O
Ser
Ser
R
R
::
:
:
O
O
C
O
..
:
:
:
O:
..
C
OH
..
..
NH
H
H
N
N
R′
His
His
N
N
H
H
Asp
Asp
O
O
O
O
RYS.3.9.Hydrolizawiązańpeptydowychkatalizowanaprzezenzymchymotrypsynę
